西施舌和琴文蛤线粒体基因组研究

摘要

西施舌(Coelomactra antiquata)隶属于软体动物门(Mollusca)双壳纲(Bivalvia)异齿亚纲(Heterodonta)帘蛤目(Veneroida)蛤蜊科(Mactridae),是我国重要的经济贝类。本研究首次测定了西施舌线粒体全基因组,西施舌线粒体基因组全序列长度为17190 bp,基因组(A+T)碱基比例为64.7％。整个线粒体基因组编码34个基因,包括12个蛋白质编码基因、2个rRNA基因和20个tRNA基因,西施舌线粒体基因组也缺少了两个tRNA:tRNASer(AGM)和tRNASer(UCN),也缺失了基因atp8。西施舌线粒体基因组的所有的基因都编码在同一条链上。在西施舌线粒体基因组最长的非编码区中,发现了8.9个拷贝的99 bp的串联重复序列。另外,西施舌的线粒体基因排列也与其它物种存在很大差别,是一种新的基因排列顺序。
　　琴文蛤隶属于软体动物门(Mollusca)双壳纲(Bivalvia)异齿亚纲(Heterodonta)帘蛤目(Veneroida)帘蛤科(Veneroidae)文蛤属(Meretrix)。本研究测定了琴文蛤线粒体基因组序列7505 bp,在获得的序列中包含了cox3和cytb基因的部分序列;5个完整基因的序列:cox1、nad1、nad2、nad4L、cox2;5个tRNA基因:tRNAla、tRNALeu(CUN)、tRNAIle、tRNAAsp、tRNAPro以及10个非编码区域。将琴文蛤已测定的5个完整蛋白质编码基因与文蛤属四个物种(文蛤M.meretrix,丽文蛤M.lusoria,斧文蛤M. Lamarckii,短文蛤M.Petechialis)比较,发现5个基因的起始密码子以及终止密码子存在一定差别。本研究基于cox1、cox2、nad1、nad2、nad4L五个基因基础上,构建了文蛤属5个物种的NJ系统发生树。本研究结果支持文蛤属为单系发生,文蛤M.meretrix与短文蛤M.petechialis具有很近的亲缘关系,但是两个物种是否为同一物种,需要今后结合其形态上的数据才能得出更确定的结论。