声明
主要符号对照表
第一章 引言
1.1 花青素
1.1.1 花青素的结构特征
1.1.2 花青素的功能
1.2 花青素合成代谢途径
1.3 花青素生物合成的调控因素
1.3.1 环境调控花青素生物合成
1.3.2 转录因子调控花青素生物合成
1.4 麦类作物花青素相关研究进展
1.4.1 大麦中花青素合成研究进展
1.4.2 小麦不同组织花青素合成研究进展
1.5 转录组测序在花青素研究中的应用
1.6 论文选题意义
第二章 转录组测序分析四倍体小麦紫粒主效基因
2.1 引言
2.2 材料与方法
2.2.1 材料
2.2.2 cDNA制备及Illumina测序
2.2.3 数据过滤与组装
2.2.4 差异基因表达分析
2.2.5 蛋白注释与分类
2.2.6 花青素合成代谢相关基因筛选以及其在小麦基因组中的定位
2.3 结果与分析
2.3.1 序列组装及编码区预测
2.3.2 蛋白注释与分类
2.3.3 差异表达基因分类
2.3.4 GO功能分类
2.3.5 KEGG通路分析
2.3.6 花青素合成代谢通路的基因表达谱及其染色体定位
2.4 讨论
第三章 TaMYC1基因的克隆及生物信息学分析
3.1 引言
3.2 材料与方法
3.2.1 材料
3.2.2 植物基因组DNA的提取
3.2.3 样本RNA提取
3.2.4 RNA反转录
3.2.5 TaMYC1基因序列的PCR扩增
3.2.6 目的片段回收
3.2.7 目的基因的TA克隆
3.2.8 E.coli热击感受态细胞的制备
3.2.9 重组质粒转化大肠杆菌
3.2.10 阳性克隆的筛选
3.2.11 生物信息学分析
3.2.12 候选基因表达谱分析
3.3 结果与分析
3.3.1 TaMYC1基因的克隆
3.3.2 系统进化分析
3.3.3 TaMYC1表达谱分析
3.4 讨论
第四章 TaMYC1基因的瞬时表达功能验证
4.1 引言
4.2 材料与方法
4.2.1 材料
4.2.2 引物设计与合成
4.2.3 Gateway入门载体的构建
4.2.4 重组质粒的转化及阳性克隆筛选
4.2.5 重组质粒的提取
4.2.6 瞬时表达载体的构建
4.2.7 基因枪介导的瞬时表达
4.3 结果与分析
4.3.1 TaMYC1基因功能验证
4.3.2 花青素斑点统计
4.4 讨论
第五章 TaMYC1基因启动子差异分析
5.1 引言
5.2 材料与方法
5.2.1 材料
5.2.2 引物设计与合成
5.2.3 DNA提取
5.2.4 目的片段扩增
5.2.5 序列分析
5.2.6 表达载体构建
5.2.7 农杆菌侵染瞬时表达
5.3 结果与分析
5.3.1 启动子的分离
5.3.2 启动子差异序列分析
5.3.3 261bp序列分析
5.3.4 启动子功能差异验证
5.4 讨论
第六章 重组自交系和自然群体中TaMYC1基因等位变异与籽粒颜色关联分析
6.1 引言
6.2 材料与方法
6.2.1 材料
6.2.2 DNA提取
6.2.3 引物设计
6.2.4 制作地理分布图
6.3 结果
6.3.1 差异引物区分紫粒与白粒表型
6.3.2 等位变异与紫粒性状的关联分析
6.3.3 等位变异在小麦紫粒性状形成中的作用
6.4 讨论
参考文献
第七章 全文总结
攻读博士学位期间科研成果简介
致谢
附录
