VEGFR1基因多态性及环境因素与年龄相关性黄斑变性的关联分析

摘要

目的：
　　1.探讨宁夏地区人群血管内皮生长因子受体1(vascular endothelial growth factor receptor1,VEGFR1)基因单核苷酸多态性与年龄相关性黄斑变性(age-related macular degeneration,AMD)的相关性及可能的环境危险因素；2.VEGFR1基因单核苷酸多态性分别与宁夏地区汉族、回族AMD的关联性；3.分别探讨VEGFR1基因单核苷酸多态性与早中期及其新生血管性AMD的关联性。
　　方法：
　　采用病例对照研究的分析方法，收集宁夏地区AMD患者432例做为病例组，其中包括汉族患者325例，回族107例；早中期患者139例，新生血管性患者287例。选择性别、民族与之相匹配的906例进行白内障手术并以能够观察眼底的患者作为对照组，包括汉族受检者698例，回族208例。收集所有受检者基本资料，除姓名、性别、年龄外，还包括吸烟史、高血压、糖尿病史等因素，并进行详细的眼科检查。提取所有受检者外周血DNA。选取VEGFR1基因上8个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)位点，运用时间飞行质谱MALDI-TOF分析软件对这些位点进行基因分型。采用SPSS17.5及plink软件包进行数据分析。运用非条件Logistic逐步回归模型对环境因素进行分析，筛选出AMD的主要环境危险因素；通过卡方检验和Logistics回归分析在不同遗传模型下各位点的基因型和等位基因频率分布及关联性研究并计算矫正后的比值比(odds ratios,ORs)和95％可信区间(95%confidence intervals,CIs)，同时对多重比较进行Bonferroni检验校正。运用Haploview4.2软件分析各连锁不平衡(linkage disequilibrium,LD)区块和基于连锁不平衡的单体型，利用置换次数为50000次的置换检验进行多重检验校正。此外，应用非条件Logistic回归对回、汉族及早中期、新生血管性AMD与VEGFR1基因型、等位基因的关联性进行分析，计算其矫正后的ORs和95%CIs值。
　　结果：
　　1.单因素及多因素Logistic回归分析后发现吸烟、高血压与AMD发生与否有统计学差异(P＜0.05)，ORs和95%CIs分别为2.147(1.556-2.943)和2.388(1.871-3.048)。在SNPs基因分型中，AMD组与对照组间共有6个SNPs位点的P值小于0.05；但经Bonferroni多重检验校正后，只有rs9554322和rs9582036两个SNPs位点的基因型和等位基因频率在AMD组与对照组间的差异具有统计学意义(P＜0.0062)。Rs9554322位点携带CC基因型个体比GG基因型罹患AMD的风险高出6倍多(OR=6.057，95%CI：3.099–11.839)。此外rs9943922位点在基因型分布和隐性模型中也与AMD显著相关(P=0.004)。在连锁不平衡分析中，我们发现位点rs9582036和rs9554320的单体型CA与AMD相关(P=0.035)，但在进行了50000次置换检验后却没有相关性。
　　2.宁夏汉族、回族患者等位基因频率差异无统计学意义(P＞0.05)。汉族AMD组与汉族正常对照组的rs9554322及rs9582036SNPs基因型分布及等位基因频率的比较差异均有统计学意义(P=0.000、P=0.006)，各位点等位基因的ORs值和95%CIs分别为1.671(1.234-2.262)及1.477(1.124-1.940)。Rs9943922在汉族病例与对照组基因型分布间差异有统计学意义(P=0.001)。宁夏回族AMD患者与回族正常对照者仅rs9554322基因型及等位基因频率分布差异有统计学意义(P=0.000)。吸烟会增加汉族AMD发病风险，差异有统计学意义(P=0.000，OR=2.622，95%CI：1.899-3.619)。
　　3.早中期及新生血管性AMD组与对照组的rs9554322SNP基因型分布及等位基因频率的比较差异均有统计学意义，等位基因的ORs和95%CIs分别为2.181(1.476-3.222)和1.838(1.376-2.454)。而rs9582036在新生血管病例与对照组等位基因分布间差异有统计学意义(P=0.002)。
　　结论：
　　1.吸烟、高血压两个因素是AMD发病的独立危险因素。VEGFR1基因的SNPs位点rs9554322，rs9582036和rs9943922与宁夏地区人群AMD的发生存在相关性，是AMD发病的危险因素。
　　2.VEGFR1基因rs9554322、rs9582036及rs9943922SNPs可能与宁夏地区汉族AMD发病相关，其中仅rs9554322与回族人群AMD有关联性。
　　3.Rs9554322与宁夏地区不同分期AMD的发病均相关，而rs9582036仅与宁夏地区新生血管性AMD患者发病有关联性。

目录

封面

声明

中文摘要

英文摘要

中英文缩略词

目录

前言

材料与方法

1. 实验材料

2. 研究对象

3. 研究方法

结果

1.受检者临床特征

2. AMD环境危险因素的分析

3. AMD与 VEGFR1基因相关性分析

4. 我们对资料人群按照回族汉族进一步分层研究所得结果如下：

5. 我们根据AMD的分型将早中期AMD及新生血管性AMD单独筛选出来进行分析结果如下：

讨论

结论

参考文献

文献综述:血管内皮生长因子基因 RS3025039多态性与年龄相关性黄斑变性关联研究的Meta分析

致谢

攻读学位期间发表的学术论文目录