荷斯坦奶牛乳房炎相关基因多态性研究

摘要

本试验研究以宁夏地区22个奶牛场2296头荷斯坦奶牛为研究对象，利用PCR-SSCP技术对MHC、SLC11A1和BLF等与奶牛乳房炎相关基因进行单核苷酸多态性分析;利用Sequenom实验技术对EEF1D、TRAPPC9、HSP70.1和TLR4等基因特定位点进行SNP genotype分析，通过分子生物学软件对基因变异位点进行多态信息分析，并采用最小二乘拟合一般线性模型对候选基因与牛奶体细胞评分的关联性进行分析。结果表明:
　　1.与荷斯坦奶牛乳房炎相关的7个候选基因检测到12个多态位点:MHC-DRA基因外显子2的C459T: SLC11A1基因外显子11的C7401G: BLF基因内含子8的T916C、G926A、G928A:EEF1D基因5'UTR区的G1A、G3A;TRAPPC9基因内含子6的G2525852T; HSP70.1基因编码区的G2409A:TLR4基因5'UTR区的rs29017188; TLR4基因内含子1的rs8193046;TLR4基因外显子3的rs8193060。
　　2.乳房炎相关基因与SCS的关联分析表明，SLC11A1基因外显子11的CC基因型SCS最小二乘均值极显著低于GC基因型(P＜0.01)，CC基因型为乳房炎抗性基因型;EEF1D-1基因位点的GA基因型SCS最小二乘均值极显著低于GG型(P＜0.01)，GA型为乳房炎抗性基因型;EEF1D-3基因位点的GG基因型SCS均值显著低于AA型(P＜0.05)，GG型为乳房炎抗性基因型;TRAPPC9-2525852基因位点的GG基因型SCS均值极显著低于TT型(P＜0.01），显著低于GT型(P＜0.05)，GG型为乳房炎抗性基因型，这一研究结果对荷斯坦奶牛抗乳房炎个体的选育提供了重要的理论依据。

目录

声明

摘要

第一章 文献综述

1．1 荷斯坦奶牛乳房炎概述

1．2 候选基因研究进展

1．3 本研究的目的意义

第二章 材料与方法

2．1 材料

2．2 实验方法与步骤

2．3 数据统计与分析方法

第三章 结果与分析

3．1 荷斯坦奶牛基因组DNA的提取和PCR扩增结果

3．2 荷斯坦奶牛乳房炎相关基因多态性分析结果

3．3 荷斯坦奶牛乳房炎相关基因Sequenom检测结果

3．4 群体遗传学统计分析结果

3．5 基因多态位点与SCS最小二乘统计分析结果

第四章 讨论

4．1 候选基因遗传特性分析

4．2 候选基因多态性分析

4．3 候选基因多态性与乳房炎相关分析

第五章 结论

参考文献

致谢

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