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miR-873调控GLI1基因在先天性心脏病中的作用研究

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摘要

英文缩略语

第一部分:miR-873调控GLI1基因表达的功能鉴定

1 前言

2.1 标本

2.2 细胞株、菌株和载体

2.3 相关分子生物学实验材料

2.4 实验仪器

2.5 国际生物学信息途径和计算机分析软件包

2.6 实验方法

3 结果

3.1 miR-873与GLI1 3’-UTR靶向结合

3.2 miR-873负调控内源性GLI1基因表达

3.3 心肌组织中miR-873与GLI1基因表达呈负相关

4 讨论

第二部分 miR-873靶向调控GLI1基因在先天性心脏病中的作用机制

5 前言

6.1 标本

6.2 细胞株、菌株和载体

6.3 相关分子生物学实验材料

6.4 实验仪器

6.5 国际生物学信息途径和计算机分析软件包

6.6 实验方法

7 实验结果

7.1 CHD患者外周血清miR-873表达升高

7.2 miR-873过表达能够抑制心肌细胞增殖

7.3 miR-873过表达使细胞周期阻滞于G1期

7.4 miR-873过表达不影响心肌细胞凋亡

7.5 miR-873过表达不影响心肌细胞自噬

7.6 miR-873过表达通过靶向GLI1基因而抑制心肌细胞增殖

7.7 miR-873过表达通过靶向GLI1基因而使细胞周期阻滞于G1期

8 讨论

9 结论

本研究创新性的自我评价

参考文献

综述 microRNA在心脏发育和心血管疾病中的研究进展

攻读学位期间取得的研究成果

致谢

个人简历

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摘要

目的:
  先天性心脏病(Congenital Heart Disease,CHD)是一类严重危害婴幼儿健康的先天畸形,在新生儿中的发病率为1%~2%,占新生儿非感染性死亡的首位。手术治疗不仅给患者及其家庭带来沉重的负担,而且近50%的患者要面临再次手术、心律失常、心力衰竭等问题。而CHD的无创产前诊断主要依靠超声影像检查,最佳时间为孕20~24周,虽有报道妊娠14周可诊断CHD,但诊断特异性较差,诊断率只有40%。因此,鉴定CHD易感基因并阐明其调控网络将具有重要的理论和实践意义。
  微小RNA(miRNA)是一类长约18~24nt的内源性、非编码单链RNA分子,通过与靶基因3'-非翻译区(3'-UTR)互补结合,在转录后水平调控靶基因的表达。miRNA作为心血管系统重要的调控因子,参与心血管系统的正常发育和相关疾病的发生。研究者已鉴定了多种与CHD密切相关的miRNA,提示miRNA在CHD的发生、发展中发挥重要作用。
  脑胶质瘤相关癌基因1(GLI1)编码一类具有五个锌指DNA结合基序的转录因子,表达于第二生心区,参与房室分隔、心脏流出道形成等。本课题组前期研究结果发现CHD患者心肌组织标本中GLI1基因表达降低,提示GLI1基因表达降低可能是其参与CHD发生的潜在机制。由于miRNA可在转录后水平调控靶基因表达,且在CHD的发生、发展中扮演重要角色,我们推测:CHD患者GLI1基因表达降低也可能受某个miRNA调控。通过生物信息学分析,我们在GLI1基因3'-UTR预测到miR-873的可能结合位点。我们设想:miR-873可能通过与GLI1基因3'-UTR互补结合,在转录后水平调控GLI1基因表达,进而参与CHD的发生。
  因此,本研究以miRNA-873为切入点,首先,通过双荧光素酶报告基因实验鉴定miR-873与GLI1基因3'-UTR的靶向结合;其次,通过过表达和表达抑制实验(体外)以及心肌组织表达相关性分析(体内)阐明miR-873对GLI1基因表达的调控机制;再次,通过CHD患者外周血清中miR-873表达分析和体外心肌细胞生物学特性分析(细胞增殖、细胞周期、细胞凋亡、细胞自噬)阐明miR-873在CHD的临床应用价值和作用机制;最后,通过恢复GLI1基因表达实验证明miR-873通过靶向调控GLI1基因表达而参与CHD发生。上述研究结果不仅为丰富GLI1基因转录后调控机制提供理论依据,而且有望为早期诊断CHD提供候选靶标。
  方法:
  1、实验材料:大鼠心肌细胞系H9C2、人胚肾细胞系HEK293、CHD患者心肌组织标本、CHD患者外周血清标本和正常对照外周血清标本。
  2、实验方法:利用生物信息学软件(TargetScan、mirSVR、PicTar)预测GLI1基因3'-UTR潜在的miRNA结合位点。分别构建野生型和突变型GLI1基因3'-UTR荧光素酶报告基因载体,与miR-873mimic共转染HEK293细胞,应用双萤光素酶检测系统进行萤光素酶活性检测。分别利用miR-873mimics(过表达实验)和miR-873inhibitor(表达抑制实验)转染大鼠心肌细胞H9C2,Real-time RT-PCR和Western Blot进行GLI1基因表达分析。常规提取心肌组织RNA,Real-time RT-PCR检测miR-873和GLI1mRNA表达水平,并应用SPSS软件进行相关性分析。常规进行CHD患者外周血清miR-873表达分析,采用MedCalc13.0软件对miR-873进行受试者工作曲线(ROC)分析,通过曲线下面积(AUC)判断miR-873作为CHD早期诊断生物标志物的诊断价值、最佳诊断临界值、敏感性、特异性。分别利用miR-873mimics和miR-873inhibitor转染大鼠心肌细胞H9C2,分析miR-873对心肌细胞生物学特性(细胞增殖、细胞周期、细胞凋亡、细胞自噬)的影响。共转染miR-873和GLI1基因表达载体pGL1进行恢复实验。
  结果:
  1、miR-873与GLH3'-UTR靶向结合。应用生物信息学软件在GLI13'-UTR175-180nt预测到miR-873可能结合位点。GLI13'-UTR与miR-873“种子序列”结合区域在人、猴、小鼠、大鼠、猪、牛等哺乳动物中具有高度保守性。miR-873mimics能够使wt-GLI1-3'UTR的荧光素酶活性降低(P<0.05),而对mut-GLI1-3'UTR的荧光素酶活性无影响,提示miR-873能够与GLI13'-UTR靶向结合。
  2、miR-873负调控内源性GLI1基因表达。与转染Negative Control相比,转染miR-873mimics后,GLI1mRNA和GLI1蛋白表达水平均降低(P<0.01),而转染miR-873inhibitor后,GLI1mRNA和GLI1蛋白表达水平均升高(P<0.01),提示miR-873可以负调控内源性GLI1基因表达。
  3、心肌组织中miR-873与GLI1基因表达呈负相关,Spearman相关系数r=-0.54(P<0.05)。
  4、与正常对照相比,CHD患者外周血清中miR-873表达升高(P<0.05)。受试者工作曲线(ROC)分析显示曲线下面积(AUC)为0.812,标准误(SE)为0.05,95%置信区间为0.714~0.888(P<0.01),最佳诊断临界值为0.3221,敏感性为88.9%,特异性为60.9%,提示miR-873可以作为一个早期诊断指标应用于临床CHD的筛查。
  5、miR-873过表达能够抑制心肌细胞增殖。与转染Negative Control相比,转染miR-873mimics后活细胞数显著减少,细胞增殖率降低,PCNA表达降低(P<0.05),而转染miR-873inhibitor后,活细胞数显著增多,细胞增殖率升高,PCNA表达升高(P<0.05),提示miR-873过表达能够抑制心肌细胞增殖。
  6、miR-873过表达使细胞周期阻滞于G1期。与转染Negative Control相比,转染miR-873mimics后S期细胞数明显减少,Cyclin E1表达降低(P<0.05),而转染miR-873inhibitor后S期细胞数明显增多,Cyclin E1表达升高(P<0.05),提示miR-873过表达能够使细胞周期阻滞于G1期。
  7、miR-873过表达不影响心肌细胞凋亡。与转染Negative Control相比,转染miR-873mimics或miR-873inhibitor后凋亡细胞无明显改变,凋亡指数也无明显变化(P>0.05),提示miR-873过表达不影响心肌细胞凋亡。
  8、miR-873过表达不影响心肌细胞自噬。与转染Negative Control相比,转染miR-873mimics或miR-873inhibitor后P62表达水平无明显改变(P>0.05),提示miR-873过表达不影响心肌细胞自噬。
  9、miR-873过表达通过靶向GLI1基因而抑制心肌细胞增殖。与转染Negative Control+pcDNA3.1相比,转染miR-873mimics+pcDNA3.1后,活细胞数显著减少,细胞增殖率降低,PCNA表达降低(P<0.05);而与转染miR-873mimics+pcDNA3.1相比,转染miR-873mimics+pGLI1后,活细胞数显著增多,细胞增殖率升高,PCNA表达升高(P<0.05),提示miR-873过表达通过靶向GLI1基因而抑制心肌细胞增殖。
  10、miR-873过表达通过靶向GLI1基因而使细胞周期阻滞于G1期。与转染Negative Control+pcDNA3.1相比,转染miR-873mimics+pcDNA3.1后,S期细胞数显著减少,Cyclin E1表达降低(P<0.05);而与转染miR-873mimics+pcDNA3.1相比,转染miR-873mimics+pGLI1后,S期细胞数显著增多,Cyclin E1表达升高(P<0.05),提示miR-873过表达通过靶向GLI1基因而使细胞周期阻滞于G1期。
  结论:
  1、GLI1基因是miR-873的靶基因之一。
  2、miR-873靶向负调控GLI1基因表达。
  3、miR-873过表达能够抑制心肌细胞增殖,使细胞周期阻滞于G1期。
  4、miR-873通过靶向GLI1基因而参与心肌细胞增殖,影响细胞周期。
  5、miR-873在CHD患者外周血清中表达升高,具有一定的临床诊断价值。

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