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摘要
英文缩略符及其中英文对照表
第一章 文献综述——植物缺磷及菌根信号转导的分子信号网络
1 缺磷信号转导途径相关基因
1.1 转录因子基因
1.2 PHF1
1.3 AtSIZ1
1.4 microRNA
1.5 TPSI1-Mt4,At4/IPS1
1.6 PHO
1.7 SPX家族
2 菌根共生信号转导途径相关基因
3 结语
第二章 研究方案及技术路线
第三章 烟草中miRNA的生物信息学预测
1 引言
2 材料与方法
2.1 生物材料
2.2 烟草GSS和EST序列及植物中已知miRNA成熟片段序列的获得
2.3 烟草中保守miRNA的预测
2.4 烟草缺磷处理
3 结果与分析
3.1 所预测miRNA各家族成员数统计
3.2 所预测miRNA成熟片段及前体长度分布
3.3 所预测miRNA特征参数统计
3.4 部分miRNA二级结构折叠
3.5 烟草miRNA399和miRNA827家族部分成员表达模式研究
4 讨论
第四章 缺磷和菌根侵染条件下番茄中miRNA表达谱的芯片分析及验证
1 引言
2 材料与方法
2.1 生物材料
2.2 番茄缺磷和菌根侵染处理
2.3 采样
2.4 菌根真菌侵染率的测定
2.5 miRNA芯片制作及数据处理
2.6 RNA提取及poly(A)-tailed RT-PCR分析
3 结果与分析
3.1 加磷、缺磷及缺磷加菌根三种处理材料的检测
3.2 miRNA芯片结果筛选
3.3 miRNA芯片结果的验证
3.4 差异表达miRNA靶基因的生物信息学预测及功能分类
4 讨论
第五章 缺磷诱导OsmiR827a及其靶基因的生物信息学和表达模式分析
1.引言
2.材料与方法
2.1 生物材料
2.2 OsmiR827a靶基因的预测
2.3 OsSPX7和OsSPX8氨基酸序列及结构域分析
2.4 水稻和拟南芥中SPX家族成员进化树分析
2.5 OsSPX7、OsSPX8及部分SPX家族其它成员亚细胞定位分析
2.6 RT-PCR检测分析
2.7 OsmiR827a、OsSPX7和OsSPX8启动子序列分析
2.8 农杆菌介导的水稻转基因
2.9 GUS报告基因的检测
3 结果与分析
3.1 miR827成熟片段在不同物种间的保守性分析
3.2 OsmiR827a靶基因的预测及分析
3.3 缺磷信号对OsmiR827a、OsSPX7和OsSPX8表达的影响
3.4 OsmiR827a、OsSPX7和OsSPX8启动子及组织定位分析
4 讨论
第六章 OsmiR827a及其靶基因的功能研究
1 引言
2 材料与方法
2.1 生物材料
2.2 农杆菌介导的水稻转基因
2.3 植物有效磷浓度的测定
2.4 RT-PCR检测分析
3 结果与分析
3.1 OsmiR827a过量表达植株的获得和鉴定
3.2 OsSPX7和OsSPX8突变纯合体的鉴定
3.3 OsSPX7和OsSPX8突变纯合体敲除效果的检测
3.4 OsSPX7和OsSPX8突变体在不同供磷处理下的表型分析
3.4 OsSPX7和OsSPX8突变体在不同供磷处理下有效磷浓度的变化
3.5 OsSPX7和OsSPX8突变对PT基因及缺磷信号转导途径中其它基因转录水平表达的影响
3.6 OsPHR2对OsmiR827a的调控分析
4 讨论
第七章 番茄和烟草Pht1;4基因启动子功能区域分析
1 引言
2 材料与方法
2.1 生物材料
2.2 重叠延伸PCR
2.3 烟草转基因操作
2.4 凝胶阻滞实验
3 结果与分析
3.1 LePT4启动子序列分析
3.2 LePT4启动子分割及定点突变
3.3 不同长度及定点突变LePT4启动子组织特异活性分析
3.4 NtPT4启动子片段与核蛋白体外结合活性分析
3.5 顺式调控元件PIBS在NtPT4响应菌根信号过程中功能解析
4 讨论
第八章 烟草缺磷和菌根信号途径转录因子基因NtPHR2和NtMYCF1的克隆、分析及表达模式研究
1 引言
2 材料与方法
2.1 生物材料
2.2 cDNA全长扩增
2.3 MYB-CC家族成员进化树分析
2.4 基因枪轰击洋葱表皮的亚细胞定位实验
2.5 酵母双杂交实验
3 结果与分析
3.1 烟草中PHR同源基因cDNA全长的克隆及序列、进化树分析
3.2 NtMYCF1和NtPHR2亚细胞定位分析
3.3 NtMYCF1和NtPHR2在缺磷及菌根共生条件下的表达模式分析
3.4 NtMYCF1和NtPHR2在蛋白水平互作分析
4 讨论
全文结论
创新点
参考文献
附录
在读期间发表的论文
致谢