基因1b型慢性丙型肝炎患者抗病毒治疗过程中氨基酸序列分析

摘要

目的：探讨基因1b型慢性丙型肝炎患者氨基酸序列变异与聚乙二醇干扰素α(PEG-IFNα)2a联合利巴韦林(RBV)抗病毒治疗疗效的关系。
　　方法：回顾性选择18例应用PEG-IFNα2a/RBV抗病毒治疗48周的基因1b型慢性丙型肝炎患者(9例为快速应答者，9例为无应答者)，应用RT-PCR法扩增接近全长的HCV基因组序列，用克隆测序方法进行核苷酸序列测定。通过在多聚蛋白和各个蛋白水平比对两组序列氨基酸突变数目及去除T细胞表位后的氨基酸突变数目，计算遗传距离等方法以比较两组序列的差别。
　　结果：抗病毒治疗前序列分析未发现与治疗应答相关的单个氨基酸变异，且系统进化分析未显示与应答相关的变异簇集现象。进一步比对发现NS5B区尤其是拇指区域的部分氨基酸序列(aa371-458)及NS5A-V3区(aa384-407)序列变异与PEG-IFNα2a联合RBV抗病毒应答情况密切相关(P值分别为0.002和0.029)。NS5B区氨基酸突变数目与V3区氨基酸突变数目存在正相关(r=0.568，.P=0.027)。NR组患者抗病毒治疗12周后的序列与基线序列相比，Core、NS3、NS4B和NS5B区域氨基酸突变数目较抗病毒治疗前略有增加，而E1、E2、P7、NS2和NS4A的氨基酸突变数目在抗病毒治疗12周后有所减少，但差别并无统计学意义，抗病毒治疗后并未发现与应答相关的单个氨基酸突变。
　　结论：NS5B区尤其是拇指区域的部分氨基酸序列及V3区序列变异与干扰素疗效密切相关，且NS5B区氨基酸突变数目与V3区氨基酸突变数目存在正相关关系。