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桑树钾离子通道及转运体相关基因的克隆及表达分析

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Abstract

绪论

1.1 研究的目的和意义

1.2研究现状

1.2.1 转录组测序的研究进展

1.2.2 钾离子通道的研究进展

1.2.3 钾转运体HAK5的研究进展

1.3 研究内容

1.3.2 桑树内向整流型K+通道KAT2基因的克隆、序列及表达分析

1.3.3 桑树弱内向整流型K+通道AKT2基因的克隆、序列及表达分析

1.3.4 桑树KCO通道KCO5基因的克隆、序列及表达分析

1.3.5 桑树高亲和钾转运体HAK5基因的克隆及分析

第2章 桑树低钾胁迫的生理生化指标测定、转录组测序初步分析及差异基因的表达鉴定

2.1 材料与方法

2.1.1植物材料和仪器

2.1.2 常用缓冲溶液和培养基

2.1.3 桑树总RNA提取

2.1.4 反转录PCR

2.1.5 桑树低钾处理后生理生化指标变化的检测分析

2.1.6桑树低钾处理后转录组测序初步分析及差异基因的表达鉴定

2.2 结果与分析

2.2.1 桑树低钾处理后生理生化指标变化的检测分析

2.2.2 测序数据及其质量控制

2.2.3 转录组数据与参考基因组序列比对

2.2.4 新基因分析

2.2.5 基因表达量分析

2.2.6 差异表达分析

2.2.7 功能注释和富集分析

2.2.8 筛选基因的鉴定分析

2.3 生理生化指标和转录组的结果与讨论

第3章 桑树内向整流型K+通道KAT2基因的克隆、序列分析及表达分析

3.1材料与常规实验(同2.1)

3.2 实验方法

3.2.1 大肠杆菌感受态细胞的制备

3.2.2桑树MaKAT2基因引物的设计

3.2.3 桑树MaKAT2基因cDNA序列的克隆验证

3.2.4桑树MaKAT2基因的生物信息学分析

3.2.5桑树MaKAT2基因在胁迫下的表达

3.3结果与分析

3.3.1 桑树MaKAT2基因的克隆验证

3.3.2 桑树MaKAT2基因的cD

3.3.3 桑树MaKAT2基因同源

3.3.4 桑树MaKAT2基因在胁

3.4 桑树MaKAT2基因的结果与讨论

第4章桑树弱内向整流型K+通道AKT2基因的克隆、序列分析及表达分析

4.1 材料与常规实验(同2.1)

4.2 实验方法

4.2.1 桑树MaAKT2基因引物的设计

4.2.2 桑树MaAKT2基因cDNA序列的克隆验证

4.2.3 桑树MaAKT2基因的生物信息学分析

4.2.4 桑树MaAKT2基因在胁迫下的表达

4.3 结果与分析

4.3.1 桑树MaAKT2基因的克隆验证

4.3.2 桑树MaAKT2基因的cD

4.3.3 桑树MaAKT2基因同源

4.3.4 桑树MaAKT2基因在胁

4.4 桑树MaAKT2基因的结果与讨论

第5章 桑树KCO通道KCO5基因的克隆、序列分析及表达分析

5.1材料与常规实验(同2.1)

5.2 实验方法

5.2.1 桑树MaKCO5基因引物的设计

5.2.2 桑树MaKCO5基因cDNA序列的克隆验证

5.2.3 桑树MaKCO5基因的生物信息学分析

5.2.4 桑树MaKCO5基因的原核表达SDS-PAGE电泳步骤及试剂配制

5.2.5 桑树MaKCO5基因在胁迫下的表达

5.3 结果与分析

5.3.1 桑树MaKCO5基因的克隆验证

5.3.2 桑树MaKCO5基因的cD

5.3.3 桑树MaKCO5基因同源

5.3.4 桑树MaKCO5基因的原核表达SDS-PAGE电泳分析

5.3.5 桑树MaKCO5基因在胁

5.4 桑树MaKCO5基因的结果与讨论

第6章 桑树高亲和钾转运体HAK5基因的克隆及分析

6.1材料与常规实验(同2.1)

6.2 实验方法

6.2.1 桑树MaHAK5基因引物的设计

6.2.2 桑树MaHAK5基因cDNA序列的克隆验证

6.2.3 桑树MaHAK5基因的生物信息学分析

6.2.4 桑树MaHAK5基因在胁迫下的表达

6.3 结果与分析

6.3.1 桑树MaHAK5基因的克隆验证

6.3.2 桑树MaHAK5基因的cD

6.3.3 桑树MaHAK5基因同源

6.3.4 桑树MaHAK5基因在胁

6.4 桑树MaHAK5基因的结果与讨论

结论

参考文献

攻读硕士学位期间发表的论文

致 谢

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