声明
摘要
第一章 绪论
1.1 前言
1.1.1 研究背景
1.1.2 基于高通量测序的RNA组学研究
1.1.3 基于高通量测序的全基因组甲基化研究
1.2 研究内容
1.3 研究目的及意义
第二章 HepG2肝癌细胞及HL-7702正常人肝细胞的mRNA表达谱分析
2.1 引言
2.2 实验材料与方法
2.2.1 细胞培养及处理
2.2.2 Total RNA提取
2.2.3 测序流程
2.2.4 mRNA测序数据的生物信息学分析
2.2.5 mRNA功能注释和KEGG通路分析
2.3 结果与讨论
2.3.1 差异表达的mRNA统计
2.3.2 表达上调的mRNA功能注释和KEGG通路分析
2.3.3 表达下调的mRNA功能注释和信号通路分析
2.4 本章小结
第三章 HepG2肝癌细胞及HL-7702正常人肝细胞的甲基化水平分析及关联分析
3.1 引言
3.2 试验材料与方法
3.2.1 细胞培养
3.2.2 Illumina Hiseq2000测序
3.2.3 测序数据质量评估
3.2.4 测序数据比对
3.2.5 差异甲基化分析
3.3 结果与讨论
3.3.1 测序数据质量评估
3.3.2 测序数据比对
3.3.3 覆盖深度分析
3.3.4 差异甲基化区域分析
3.3.5 甲基化与基因表达关联分析
3.4 本章小结
第四章 总结与展望
4.1 总结
4.2 展望
致谢
参考文献
个人简介
东南大学;