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基于GWAS结果的中国汉族人群原发性胆汁性胆管炎易感基因JAK1多态性研究

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原发性胆汁性胆管炎(primary biliary cholangitis,PBC),旧称原发性胆汁性肝硬化(primary biliary cirrhosis),它是一种慢性进行性肝内胆汁淤积性自身免疫性疾病,最终可发展为严重肝病,包括肝硬化,肝功能衰竭甚至肝细胞癌。该病好发于中年女性,遗传和环境因素共同作用是导致PBC发病的主要原因。患者的第一级亲属的PBC发病率比一般人群高100倍,其中个体的遗传易感性是PBC发生的主要内在原因。多个针对不同人种的全基因组关联研究(genome-wide association study,GWAS)的结果也进一步确认了PBC发生的强遗传易感性,且在不同人种间有显著的差异。 为了研究中国汉族PBC人群遗传易感性并比较与其他人群的差异,本课题针对课题组前期PBC患者的GWAS结果,对JAK1上所有显著性位点进行分析,并对JAK1的两个显著性SNP:rs7531799和rs4915675进行疾病关联性验证工作。依据美国肝病研究学会(American Association for the Study of Liver Diseases,AASLD)推荐的PBC诊断标准,共收集了1545例PBC患者和2227例健康对照进行病例-对照的研究。利用TaqMan-MGB探针实时PCR法对JAK1基因SNP rs7531799和SNP rs4915675位点进行基因分型,用IBM SPSS19.0软件和Haploview4.2软件对数据资料进行统计学分析。 经过验证分析并结合GWAS数据表明:SNP rs7531799显著性达到了全基因组阈值要求,提示JAK1很有可能是中国汉族PBC中的一个显著的遗传易感基因。同时,SNP rs7531799能够解释JAK1的易感性。此项研究是目前国内首次在大规模中国汉族PBC人群对JAK1多态性的发现及验证。

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