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前言
1石蒜属植物概况
2石蒜属植物花型、花色变异特征
3石蒜属植物资源的开发利用
4研究目的及实验流程
第一章国内外研究进展
1基因文库
1.1基因组文库
1.2 cDNA文库
2自动DNA测序技术
2.1自动DNA测序原理(以ABI全自动DNA测序仪3100型为例)
2.2数据的收集与分析
3 EST技术及其应用
3.1 EST技术的原理
3.2 EST技术的形成与发展
3.2 EST技术的应用
3.3 EST研究的主要步骤
4生物信息学在EST研究中的应用
4.1生物信息学
4.2公共数据库
4.3生物信息学在EST数据分析中的应用
5植物开花相关基因研究
5.1植物成花机理
5.2花色调控机理
5.3花卉EST研究
6植物叶发育研究
6.1植物叶发育调控机理
6.2叶发育相关基因研究
第二章忽地笑野生型和突变型叶片cDNA文库构建与分析
1实验材料
1.1植物材料
1.2样品采集
1.3实验试剂与仪器设备
2方法
2.1忽地笑叶片总RNA提取
2.2 mRNA的分离
2.3 cDNA文库的构建
3结果与分析
3.1 RNA定量与质量
3.2 mRNA的定量与质量
3.3 cDNA大小片段的过柱分离
3.4文库滴度的测定
3.5 cDNA文库的片段大小
4讨论
4.1 RNA的稳定性
4.2 cDNA文库质量检测
4.3 cDNA文库用途
第三章忽地笑野生型和突变型叶片EST序列测定
1材料与方法
1.1实验材料
1.2实验方法
2结果与分析
2.1大规模质粒提取
2.2大规模序列测定
3讨论
3.1关于质粒提取
3.2关于测序
第四章石蒜属植物表达序列标签(EST)分析
1实验材料与方法
1.1分析材料
1.2生物信息学分析
2结果与分析
2.1有效EST的获得
2.2序列提交
2.3片段重叠群分析及基因表达丰度分析
2.4长筒石蒜花苞EST序列同源性比较分析
2.5忽地笑叶片野生型和突变型的EST序列同源性比较分析
3讨论
3.1连续重叠群与EST的聚类
3.2 EST与数据库同源性比较
参考文献
图版
