利用SSR标记构建杂交水稻品种DNA指纹数据库

摘要

杂交水稻新品种作为种业发展的基础,无论是在质量和数量上,都得到突飞猛进的发展,但由于技术的限制,现实中各种品种侵权现象屡见不鲜。为了解决这一问题,本研究利用前期建立的一套杂交水稻品种DNA指纹检测体系,对2001-2008年湖南省主要的杂交水稻品种43个、2009-2011年湖南省区试杂交水稻品种140个、其他省份应用较广泛的杂交稻品种130个进行了DNA指纹检测。
　　 主要研究结果如下:
　　 根据带型清晰,多态性高,基因组分布均衡原则,筛选确定了用于DNA指纹数据库构建的48对SSR引物;
　　 构建了313个杂交水稻品种×48个SSR标记的DNA指纹图谱数据库,为进一步规范和完善湖南省杂交水稻品种区试、审定及管理工作提供技术支持。
　　 利用48对SSR引物分析了从2009年到2011年参与湖南省品种审定的杂交稻组合的相似系数,对2009-2011年的140个杂交水稻品种的遗传多样性进行了聚类(系谱)分析。其中,2009年杂交组合间的平均遗传相似系数是0.725,变幅为0.47-0.98,2010年的平均遗传相似系数是0.69,变幅为0.53-0.85,2011年的平均遗传相似系数是0.695,变幅为0.56-0.83。聚类分析显示,本研究中的水稻品种种质资源遗传多样性相对狭窄,杂交稻的遗传育种基础需要进一步拓宽。
　　 本研究构建的数据库具有品种的广泛代表性和容量的无限扩展性,技术先进准确且易标准化。为了充分共享该研究成果,已将数据库公布到因特网上。

目录

文摘

英文文摘

第一章 综述

1.1 前言

1.2 水稻遗传多样性的研究现状

1.3 农作物品种指纹数据库的构建及应用

1.3.1 蛋白质电泳图谱及同工酶的应用

1.3.2 DNA指纹图谱及SSR标记的优点

1.3.3 指纹数据库的应用前景

第二章 利用SSR标记构建杂交水稻品种DNA指纹数据库

2.1 材料与方法

2.1.1 杂交水稻材料

2.1.2 全基因组DNA提取

2.1.3 SSR标记筛选

2.1.4 PCR扩增和PCR产物电泳

2.1.5 图片处理和统计

2.2 结果与分析

2.2.1 供试引物的确定

2.2.2 带型记录和图片处理

2.2.3 单个品种的DNA指纹

2.2.4 2001-2008年通过湖南省审定的43个杂交稻品种的DNA指纹数据

2.2.5 2009年通过湖南省审定的50个杂交稻品种DNA指纹

2.2.6 2010年和2011年参加湖南省区试的杂交稻品种DNA指纹

2.2.7 DNA指纹数据库的构建和特征

2.2.8 2009-2011年湖南省审定的杂交稻组合的遗传多样性分析

2.3 讨论

第三章 全文结论

参考文献

附录:本研究构建的数据库中杂交稻组合名称清单

致谢

攻读学位期间主要的研究成果目录