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系统性红斑狼疮病人血浆miRNAs差异表达谱研究

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主要缩略英文索引

第一章 引 言

1.1 系统性红斑狼疮发病与研究现状

1.2 miRNA与系统性红斑狼疮

1.3 miRNA芯片检测技术

1.4 研究内容

第2章 材料与方法

2.1 材料

2.2 实验方法

第3章结果

3.1 总RNA质量合格判断

3.2 基因芯片扫描结果

3.3 基因芯片检测到的差异表达miRNAs

3.4 miRNAs差异表达谱的聚类分析(Cluster)

3.5 qRT-PCR检测miR-21,miR-146a表达水平

3.6 miR-21和miR-146a生物信息学分析

第4章 讨论

4.1 SLE研究现状

4.2 SLE与miRNA研究进展

4.3 生物信息学分析基因芯片结果

第5章 结论

参考文献

综述:自身免疫性疾病发病机理中miRNA的作用

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致谢

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摘要

目的:通过基因芯片技术获得系统性红斑狼疮病人和健康人血浆中miRNA差异表达谱,以获得用于诊断和治疗系统性红斑狼疮的分子标记物。
  方法:收集18例系统性红斑狼疮病人和10例健康人的血浆标本,分别提取总RNA;采用miRNA基因芯片技术检测统性红斑狼疮病人和健康人血浆中差异表达的miRNA;选取表达差异最大两个miRNAs,通过qRT-PCR技术检其表达水平,并与基因芯片结果进行对比,分析这两个miRNAs在系统性红斑狼疮的发生发展中的作用。通过生物信息学方法分析这两个miRNAs所分别调控的靶基因和信号通路。
  结果:
  1.获得系统性红斑狼疮病人的miRNA差异表达谱。SLE病人血浆中有35个miRNAs表达上调,上调倍数最大的为miR-21,上调26.1235倍;有14个miRNAs表达下调,下调倍数最大的为miR-146a,下调0.0512倍。
  2.18例SLE病人中,miR-21的相对平均值为33.5±2.2,10例健康人中,miR-21的相对平均值为2.8±0.5,上调倍数为11.9642倍;18例SLE病人中,miR-146a的相对平均值为1.3±0.1,10例健康人中,miR-146a的相对平均值为5.7±1.3,下调倍数为0.2281倍。
  3. miR-21、miR-146a在qRT-PCR检测中的结果与基因芯片中的表达趋势一致,说明基因芯片结果是可靠的。
  4.生物信息学分析发现,miR-21调控的靶基因有307个,涉及到的信号通路主要有:EGF、TGF-beta、MAPK、Jak-STAT、神经营养因子信号通路等;miR-146a调控的靶基因有224个,涉及到的信号通路主要有:MAPK、Notch、Fas信号通路等。
  结论:
  1.获得了SLE病人的miRNAs差异表达谱,在SLE血浆中,上调的miRNAs有35个,下调的miRNAs有14个。
  2. SLE病人中,上调倍数最大的为miR-21;下调倍数最大的为miR-146a,两者RT-PCR检测结果与基因芯片结果一致。
  3. miR-21和miR-146a可能在SLE发生发展中具有重要作用。

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