声明
摘要
1 前言
1.1 土壤微生物
1.2 土壤中的微生物多样性
1.2.1 土壤微生物多样性调查方法
1.2.2 微生物多样性研究进展
1.3 土壤铁锰氧化物及铁锰结核
1.4 微生物在铁锰元素地球化学循环中的作用及生物锰氧化物形成机制
1.5 研究目的和意义
1.6 技术路线
2 四种地带性土壤及铁锰结核中微生物多样性研究
2.1 引言
2.2 材料和方法
2.2.1 供试土壤及铁锰结核
2.2.2 土壤及铁锰结核采集
2.2.3 土壤及铁锰结核DNA提取
2.2.4 实时荧光定量PCR分析
2.2.5 克隆文库构建
2.2.6 测序及系统发育树分析
2.2.7 微生物种群多样性分析
2.3 结果与分析
2.3.1 土壤和铁锰结核中细菌的丰度
2.3.2 土壤和铁锰结核中细菌群落的多样性分析
2.3.3 土壤和铁锰结核中细菌群落的聚类分析
2.3.4 土壤和铁锰结核中细菌群落组成
2.3.5 土壤和铁锰结核中主要细菌种群的系统发育分析
2.3.6 土壤和铁锰结核中古菌的丰度
2.3.7 土壤和铁锰结核中古菌群落的多样性分析
2.3.8 土壤和铁锰结核中古菌群落的聚类分析
2.3.9 土壤和铁锰结核中古菌群落组成
2.3.10 土壤和铁锰结核中古菌种群的系统发育分析
2.4 讨论
2.4.1 土壤和铁锰结核中细菌和古菌多样性
2.4.2 土壤和铁锰结核中细菌种群差异及影响因素
2.4.3 土壤和铁锰结核中细菌的潜在生态学功能
2.4.4 土壤和铁锰结核中古菌种群差异及影响因素
2.4.5 土壤及铁锰结核中古菌的潜在生态学功能
2.5 小结
3 神农架山地土壤微生物多样性研究
3.1 引言
3.2 材料与方法
3.2.1 供试土壤
3.2.2 土壤采集
3.2.3 土壤样品处理
3.2.4 实时荧光定量PCR分析
3.2.5 PCR扩增及Miseq边合成法测序
3.2.6 序列处理及数据分析
3.3 结果与分析
3.3.1 不同海拔山地土壤理化性质
3.3.2 不同海拔山地土壤中细菌和古菌的丰度
3.3.3 不同海拔山地土壤中微生物多样性
3.3.4 不同海拔山地土壤中微生物群落聚类分析
3.3.5 不同海拔山地土壤中微生物的群落组成
3.4 讨论
3.5 小结
4 结论与展望
4.1 结论
4.2 展望
5 论文创新点
参考文献
附录
博士期间撰写与发表的文章
致谢