声明
摘要
缩略词表
1 前言
1.1 大豆的重要价值和现状
1.2 共生固氮的意义
1.3 豆科植物与根瘤菌建立共生关系
1.4 表观组学
1.5 DNA甲基化
1.5.1 DNA甲基化的概念
1.5.2 DNA甲基化的分布特点
1.5.3 DNA甲基化与去甲基化
1.5.4 DNA甲基化的检测方法
1.5.5 植物中DNA甲基化的研究进展
1.6 研究目的和意义
2 材料和方法
2.1 材料
2.2 数据来源
2.3 分析流程
2.3.1 数据的预处理
2.3.2 比对
2.3.3 覆盖度和测序深度
2.3.4 全基因组DNA甲基化分析
2.3.5 区域DNA甲基化分析
2.3.6 鉴定差异甲基化区域(DMRs)
3 结果与分析
3.1 测序数据的质量控制
3.2 比对情况的统计
3.3 覆盖度和测序深度
3.4 全基因组DNA甲基化分析
3.5 转座元件区域DNA甲基化分析
3.6 基因区DNA甲基化分析
3.7 鉴定差异甲基化区域(DMRs)
3.8 鉴定与DMRs相关的转座元件
3.9 鉴定差异甲基化基因(DMGs)
3.10 DMGs与DEGs的关联分析
4 讨论
参考文献
致谢
华中农业大学;