声明
摘要
常用中英文缩略语表
1前言
1．1研究问题的由来
1．2文献综述
1．2．1禽类脑疝的研究进展
1．2．2禽类凤头性状的研究进展
1．2．3鸡端脑结构的研究进展
1．2．4禽类端脑的发生发育过程
1．2．5和大脑神经疾病相关的信号通路
1．2．6转录组测序技术的研究进展
1．3本研究的目的与意义
2试验材料与方法
2．1试验材料
2．1．1组织样品
2．1．2主要的仪器设备
2．1．3主要的分子生物学试剂
2．1．4其他试验用生化试剂的配制
2．2试验方法
2．2．1石蜡切片
2．2．2尼氏染色
2．2．3RNA提取以及qPCR
2．2．4免疫组织化学
2．2．5 RNA测序分析
2．2．6转录组测序生物信息分析流程
2．2．7测序数据质量评估
2．2．8参考序列比对分析
2．2．9样本重复性的检验
2．2．10差异基因功能分析
3试验结果
3．1鸡(脑疝表型)和鸡(对照表型)端脑的形态学特点鉴定和分析
3．1．1鸡(脑疝表型)和鸡(对照表型)端脑组织解剖形态学比较
3．1．2鸡(脑疝表型)和鸡(对照表型)端脑组织局部形态学比较
3．1．3神经元标记基因鉴定鸡(对照表型)和鸡(脑疝表型)中端脑组织的神经元分布
3．2调控鸡脑疝形成的分子网络和候选基因的筛选与鉴定
3．2．1鸡(脑疝表型VS对照表型)测序Total RNA提取和质检
3．2．2转录组测序数据质量评估和参考序列比对分析
3．2．3鸡(脑疝表型VS对照表型)端脑组织的差异表达基因富集与筛选
3．2．4鸡(脑疝表型VS对照表型)端脑组织的差异基因GO注释分类
3．2．5鸡(脑疝表型VS对照表型)的差异基因KEGG富集分析
2．2．6转录组测序生物信息分析流程
3．2．7 qPCR验证鸡(脑疝表型VS对照表型)差异表达的关键基因
4讨论
4．1鸡(脑疝表型)与波兰鸡具有类似的脑部结构变异
4．2蛋白磷酸化对端脑异常发育的影响
4．3血脑屏障对端脑异常发育的影响
4．4相关信号通路候选基因在脑疝中的功能
4．4．1 COL3A1通过硬化脑部血管促进脑疝的形成
4．4．2 S100A10促进神经元细胞发育修复端脑损伤
4．4．3 THBS4通过促进神经细胞和神经胶质细胞的增殖发挥神经保护作用
4．4．4 GFAP促进星型胶质细胞增殖并有助于修复神经损伤
4．4．5 RICTOR通过促进神经元突起的形成保护端脑
5小结
5．1本研究结论
5．2本研究的特色与创新点
5．3本研究的不足之处及下一步工作建议
参考文献
附录
致谢
