肺动脉闭锁遗传学初步研究

摘要

第一部分肺动脉闭锁染色体核型分析
　　【目的】对肺动脉闭锁患儿进行核型检测,分析染色体异常与肺动脉闭锁的关系。
　　【方法】35例肺动脉闭锁患儿行G显带常染色体检测。
　　【结果】发现1例合并有21三体综合征,余染色体核型正常。
　　【结论】21三体综合征可合并有肺动脉闭锁,肺动脉闭锁患儿染色体核型异常并不多见,提示应用常规染色体核型分析无法对这种严重复杂的先心病进行筛查。
　　第二部分肺动脉闭锁TBX1微缺失研究
　　【目的】对肺动脉闭锁患儿进行TBX1微缺失检测,探讨肺动脉闭锁与TBX1的关系。
　　【方法】选用荷兰Kreatech公司PoseidonFISHDNA的KBI-40104MDDiGeorgeT-box1(22q11)/22q13(SHANK3),应用染色体原位荧光杂交技术(FISH)对染色体核型正常的34例肺动脉闭锁患儿进行TBX1微缺失检测。
　　【结果】发现3例TBX1微缺失阳性患儿,阳性率为8.82％。
　　【结论】TBX1是22q11.2微缺失的核心基因,22q11.2微缺失是肺动脉闭锁的主要致病原因之一,TBX1可能是肺动脉闭锁易感基因。
　　第三部分全外显子测序初步筛选右室流出道梗阻易感基因
　　【目的】对一个右室流出道梗阻家系中2名成员进行全外显子测序,进行数据分析,初步筛选右室流出道梗阻易感基因。
　　【方法】收集一个右室流出道梗阻家系中2名成员的静脉血,采用lifetechnology全外显子捕获试剂盒进行捕获,用Lifetechnologysolid5500xl高通量测序仪进行高通量测序,测序结果与公共遗传突变数据库(db132SNP)及华中科技大学人类基因组中心正常人外显子数据库进行比对,过滤已报道的常见变异,再将单核苷酸非同义突变进行整合,初步筛选出候选基因。
　　【结果】结果显示过滤后落在外显子区域的单核苷酸变异(SNP)数目外婆为42727个,孙子为38207个;过滤后落在外显子区域未报道的单核苷酸变异数目外婆为4582个,孙子为4249个;通过ACCESS数据分析发现,有121个新发现单核苷酸变异同时存在于祖孙两人的基因组中。同时使用华中科技大学人类基因组中心已有正常人外显子对照数据库进行筛选,46个变异没有在对照数据库中发现。将46个变异输入到使用ANNOVAR软件预测可能有害的突变位点,将候选基因范围缩小到19个。
　　【结论】WNK1、KRTAP1-1、UBR2、EPS15、CKAP2、PIGB、DENND4A、HYDIN、CNTN3、NDUFC2、SAMD9L、KIAA0825、C7orf58、NCKAP5、SPINK5、VPS45、FCRL3、TTN、MUC等19个基因可能是右室流出道梗阻易感基因,但须进一步确认。

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缩略词

中文摘要

英文摘要

前言

参考文献

第一部分 肺动脉闭锁染色体核型分析

实验对象与方法

结果

讨论

结论

参考文献

第二部分 肺动脉闭锁TBX1微缺失研究

实验对象与方法

结果

讨论

结论

参考文献

第三部分 全外显子测序初步筛选右室流出道梗阻的易感基因

对象与方法

结果

讨论

结论

参考文献

结论、创新与展望

综述

附录

致谢