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几类具有混合时滞基因调控网络的状态估计与滤波

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摘要

第1章 绪论

1.1 课题来源和研究的目的及意义

1.1.1 课题来源

1.1.2 课题研究的目的及意义

1.2 国内外研究现状

1.2.1 基因调控网络稳定性分析研究现状

1.2.2 基因调控网络状态估计与滤波研究现状

1.3 本文主要内容

第2章 基于采样方法的时滞基因调控网络的鲁棒状态估计

2.1 时滞基因调控网络模型描述

2.2 系统鲁棒稳定性分析

2.3 鲁棒状态估计器设计

2.4 算例仿真

2.5 本章小结

第3章 基于采样方法的随机时滞基因调控网络的鲁棒H∞状态估计

3.1 随机时滞基因调控网络模型描述

3.2 系统鲁棒稳定性及H∞性能分析

3.3 鲁棒H∞状态估计器设计

3.4 算例仿真

3.5 本章小结

第4章 离散时滞基因调控网络的递推滤波

4.1 离散时滞基因调控网络模型描述

4.2 递推滤波器设计

4.3 递推滤波器性能分析

4.4 算例仿真

4.5 本章小结

结论

参考文献

攻读学位期间发表的学术论文

致谢

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摘要

众所周知,基因表达是从基因到蛋白质的过程,主要由基因的转录和mRNA的翻译组成,调控基因表达的机制被称为基因调控网络。基因调控网络已经在生物学和生物医学领域引起广泛关注,通过对基因表达的调控,可以使微生物有效合成有益菌种,并用于医学治疗。因此,研究基因调控网络有着十分重要的实际意义。
  由于转录、翻译和易位的过程缓慢,时滞在基因调控网络中是不可避免的,且建模过程带来的参数波动以及环境变化造成的外部扰动,均使得系统复杂化,导致基因调控网络的状态难以获得,一般来说需要利用可获得的测量数据估计系统的状态。然而,在使用计算机测量网络信息时,一个重要的问题是对连续系统的离散化,即采样,亦即计算机测量的信息实际上是某些离散点的采样数据。因此,本文的研究目的是通过可获得的离散采样数据对具有实变时滞、随机时滞、定常时滞和测量时滞基因调控网络的状态估计问题进行研究,设计状态估计器和递推滤波器估计其中状态mRNA和蛋白质的浓度。
  首先,研究时滞不确定基因调控网络的状态估计问题。对于具有时变时滞和不确定参数的基因调控网络,利用采样数据构造可测量输出,设计了基于可测量输出的鲁棒状态估计器;利用Lyapunov方法,借助Jensen不等式和下界定理,得出保证原系统和误差系统全局鲁棒渐近稳定的充分条件,并设计估计器增益矩阵。对于具有随机时滞、不确定参数和外部扰动的基因调控网络,类似地设计了基于可测量数据的鲁棒H∞状态估计器;利用Lyapunov方法,借助下界定理和自由权矩阵方法,得出保证增广系统在均方意义下全局鲁棒渐近稳定且满足H∞性能的条件,并设计估计器增益矩阵。通过数值仿真验证上述所得状态估计器的有效性和可行性。
  其次,研究时滞基因调控网络的滤波问题。对于具有状态时滞和随机一步测量时滞的离散基因调控网络,利用状态增广方法和Riccati方程方法,设计递推滤波器,计算滤波误差协方差矩阵并估计其上界,通过配方法得到最小化该上界的滤波器增益矩阵;利用滤波误差的有界性分析递推滤波器的性能,并给出保证滤波误差指数有界的充分条件;通过数值算例验证递推滤波的有效性。

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