二倍体和四倍体白花泡桐响应盐胁迫蛋白质组变化研究

摘要

土壤盐渍化一直是困扰农业生产的一大难题，对于土地资源日趋紧张的今天，如何合理利用盐渍化土壤成为了当今各国的一个重要课题。运用蛋白质组学的研究方法研究植物在盐胁迫下的应答机制，发掘参与盐应答反应的关键蛋白，对于全面揭示植物的抗盐机理有重要的意义。
　　本研究通过基于质谱的蛋白质组学同位素标记相对和绝对定量(isobaric tags for relative and absolute quantitation，iTRAQ)技术，以AB SCIEX Triple TOFTM5600液相色谱串联质谱仪为研究平台，分析研究了二倍体和四倍体白花泡桐盐胁迫处理后的表达差异，为进一步研究相关基因及其编码的蛋白功能打下基础，以探究泡桐抗盐分子机制。在本次质谱实验中共鉴定到2851个蛋白，8590个肽段，其中含7221个Unique肽段，并对这2851个蛋白进行GO（Gene Ontology）COG（Cluster of Ortholog Genes）KEGG（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes）注释分析，这些蛋白被注释到47个GO条目上，属于24个COG cluster，涉及到128个Pathway。当蛋白质丰度水平差异倍数达到1.2倍以上，且经统计检验其p-value值小于0.05时，视为差异蛋白。在B2/B4中，上调蛋白270个，下调蛋白254个；B2-0.4/B4-0.4中，上调蛋白263个，下调蛋白198个；B2/B2-0.4中，上调蛋白363个，下调蛋白303个；B4/B4-0.4中，上调蛋白391个，下调蛋白247个。通过对比方案我们得到了34个蛋白，其参与19个KEGG pathway，26个GO terms，和11个COG分类，这34个蛋白参与光合作用、植物病原菌互作、植物激素信号传导、谷胱甘肽代谢和内质网蛋白质合成、苯丙烷生物合成等代谢通路。
　　本研究首次将蛋白质组学研究方法应用于泡桐响应盐胁迫调节机制的研究，这些研究对于进一步探究泡桐的耐盐机制和新的抗盐品种培育、合理利用盐渍土壤有着极其重要的作用。

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中文摘要

1文献综述

1.1植物盐胁迫在国内外的研究进展

1.2植物蛋白质组研究

1.3二倍体和四倍体泡桐的研究

1.4本文研究的目的和意义

2引言

3材料与方法

3.1试验材料及盐处理

3.2主要试剂和仪器设备

3.3蛋白质提取

3.4iTRAQ实验

3.5生物信息学分析

3.6总RNA的提取

3.7 qRT-PCR验证

4结果与分析

4.1样品蛋白质含量

4.2蛋白质鉴定

4.3蛋白质注释

4.4差异蛋白统计

4.5蛋白质组与转录组的关联分析

4.6差异表达蛋白的qRT-PCR验证

5结论与讨论

参考文献

英文摘要