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洛阳地区烟株根围拮抗放线菌筛选与土壤放线菌多样性分析

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目录

第1章 文献综述

1.1 放线菌的研究概述

1.1.1 放线菌的分类地位

1.1.2 放线菌的分类鉴定方法

1.1.3 放线菌在植物病害防治上的应用

1.1.4 放线菌在烟草病害防治上的应用

1.1.5 放线菌的生物防治机制

1.2 土壤微生物多样性的研究概述

1.2.1 土壤微生物多样性的含义

1.2.2 土壤微生物多样性的研究方法

1.2.3 Illumina MiSeq测序技术在土壤微生物多样性研究中的应用

1.3 本研究的目的及意义

第2章 烟株根围土壤中抗烟草疫霉放线菌的筛选

2.1 材料与方法

2.1.1 试验材料

2.1.2 培养基

2.1.3 根围放线菌的纯化

2.1.4 拮抗放线菌的初筛

2.1.5 拮抗放线菌的复筛

2.2 结果与分析

2.2.1 根围放线菌的纯化

2.2.2 拮抗放线菌的初筛

2.2.3 拮抗放线菌的复筛

2.3 小结与讨论

2.3.1 小结

2.3.2 讨论

第3章 拮抗放线菌的形态及生理生化特征

3.1 材料与方法

3.1.1 试验材料

3.1.2 培养基

3.1.3 形态及培养特征观察

3.1.4 生理生化特征观察

3.2 结果与分析

3.2.1 形态及培养特征

3.2.2 生理生化特征

3.3 小结与讨论

3.3.1 小结

3.3.2 讨论

第4章 拮抗放线菌的分子鉴定

4.1 试验与材料

4.1.1 试验材料

4.1.2 主要仪器

4.1.3 主要试剂

4.1.4 放线菌DNA提取方法

4.1.5 放线菌16S rDNA的扩增

4.1.6 放线菌系统发育树的构建

4.2 结果与分析

4.2.1 待续菌株的比对

4.2.2 待测菌株的系统发育树

4.3 小结与讨论

4.3.1 小结

4.3.2 讨论

第5章 烟株根围土壤放线菌的多样性及群落结构分析

5.1 材料与方法

5.1.1 试验材料

5.1.2 田间试验设计

5.1.3 样品采集

5.1.4 烟株根围土壤中放线菌的检测

5.2 结果与分析

5.2.1 样品测序结果及取样深度验证

5.2.2 样品稀释度曲线分析

5.2.3 Alpha多样性指数分析

5.2.4 OTU Rank曲线分析

5.2.5 韦恩图分析

5.2.6 物种丰度分析

5.3 小结与讨论

5.3.1 小结

5.3.2 讨论

第6章 结论

参考文献

缩略语词汇表

附录Ⅰ拮抗放线菌对烟草疫霉的拮抗效果

附录Ⅱ拮抗放线菌的鉴定

致谢

攻读学位期间的研究成果

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