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黑龙江省部分地区肾型传支S基因的克隆与序列分析

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第一章引言

第二章文献综述禽传染性支气管炎病毒纤突蛋白(S)的研究进展

第三章材料与方法

第四章结果与分析

第五章讨论

第六章结论

参考文献

致谢

附 录

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摘要

本课题针对传支病毒S基因的高变性,参考genebank已发表的IBV纤突蛋白基因序列,设计了三对引物,对鸡传染性支气管炎病毒黑龙江肾型分离株MG/MK/K和澳大利亚标准株Υ株RNA进行RT-PCR扩增,并将扩增后得到的PCR产物克隆入pMD-18T克隆载体中进行序列测定和分析。结果显示为IBVS基因。测序分析显示,S基因的核苷酸全长为3498bp,编码一条由1166个氨基酸组成的多肽,S1基因是IBV的高变区序列,S2基因相对比较保守,3'端核苷酸相对于5'端保守,与网上报道的相一致。地方分离株MG株、MK株、K株分别和标准株T株比较,其同源性分别为89.2%、91.9%和91.4%。而MG和MK株的同源性为96.4%,MG和K株的同源性为95.7%,MK和K株的同源性为99.3%。地方分离株的亲缘关系较近,而和T株的亲缘关系较远。MK和K株还可能是由同一株病毒变异而来,或者是同一株病毒在传代的过程中发生了点突变造成的。S基因的克隆与测序添补了国内在IBV序列数据上的不足,为应用地方分离株制造疫苗奠定了基础,使控制和消灭黑龙江省地区鸡传染性支气管炎成为可能。

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