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影响棕色和白色脂肪分化相关长链非编码RNA表达谱特征研究

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摘要

前言

1.材料与方法

2.结果

3.讨论

小结

附图

参考文献

综述 LncRNA的功能及在肥胖和其他疾病中的研究进展

附录 中英文缩略词对照表

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摘要

背景:
  长链非编码RNA(LncRNAs)是参与多种生物功能普遍存在的一类重要基因,它可以作为参与转录调控的关键共活化因子。众所周知,白色脂肪的功能是贮存能量而棕色脂肪是消耗能量。白色和棕色脂肪细胞均起源于中胚层。然而,目前尚不清楚LncRNAs是否在棕色脂肪和白色脂肪的能量代谢和成脂分化中起到作用。
  目的:
  研究LncRNAs在棕色和白色脂肪中表达谱的差异特征,明确LncRNAs是否参与棕色脂肪和白色脂肪的能量代谢和成脂分化这一生物过程。为今后在治疗肥胖提供了理论基础。
  方法:
  首先,采用免疫组化法来鉴别棕色脂肪,随后分别提取棕色脂肪和白色脂肪的总RNA并对总RNA的质量鉴定;采用实时荧光定量PCR,对这些差异倍数大的LncRNAs进行验证;为了揭示这些LncRNAs的潜在功能,通过GO和Pathway分析方法,对这些表达差异的LncRNAs进行了分析,并且通过斯皮尔曼相关分析和生物信息学分析对基因AK142386和AK133540的潜在相关靶基因进行了预测;
  结果:
  解偶联蛋白-1(uncoupling protein-1 UCP-1)免疫组化显示阳性着色较深的为棕色脂肪组织;利用第二代测序技术和芯片技术,通过比较棕色脂肪组织和白色脂肪组织分化相关LncRNA表达谱特征,发现了735个上调和877个下调的LncRNA(差异倍数大于4)。实时荧光定量PCR结果显示所挑选出的基因差异性表达符合芯片结果;GO和Pathway分析,发现了AK142386和AK133540影响了脂肪生成和能量代谢;斯皮尔曼和生物信息学分析,Hoxa3和Acad10分别是基因AK142386和AK133540的相关靶基因,推测可能通过其影响能量代谢。
  结论:
  通过实验验证和生物信息学的方法,分析了棕色脂肪和白色脂肪LncRNA的差异表达谱特征,也证实本研究芯片数据有较高的可重复性,总之通过芯片结果已经确定了大量的LncRNAs,这些LncRNAs在脂肪形成和能量代谢中具有重要的调控功能。

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