MMPs基因启动子区5个SNPs与河南汉族群体CHF遗传易感性的关联研究

摘要

慢性充血性心力衰竭（chronic heart failure,CHF）是一种严重影响人类健康的一种疾病。现在人们正在深入探索该疾病发生的分子机制。基质金属蛋白酶(matrix metalloproteinases，MMPs)活性的增强与表达的改变，对脉管系统及心脏组织的重构产生严重的影响，造成心血管系统的损害，结果将会造成心功能恶化甚至心衰。 目的： 研究MMPs基因启动子区5个单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphis-ms，SNPs）与河南汉族群体慢性充血性心力衰竭的关系，以探讨河南汉族群体慢性充血性心力衰竭发病的分子机制。 方法： 1、样本收集与基因组DNA提取：根据知情同意的原则，收集CHF患者160例，正常对照186例，酚/氯仿方法提取基因组DNA。 2、SNPs位点检测及分型方法：采用限制性扩增片段长度多态性（polymerase chain reaction–restriction fragment length polymorphism，PCR-RFLP）的方法检测MMPs基因rs2285053,rs243865,rs11568818,rs11225395及rs225207共5个单核苷酸多态性。 3、统计学原理分析：将不同的每组基因型及等位基因制成Excle表格，采用病例-对照分析，运用SHEsis软件，将病例组与对照组间频数及频率分布进行比较分析、Hardy-Weinberg平衡检验、单体型推断、比值比（odd ratio,OR）及95%置信区间（confidence interval，CI）计算；并分析3个多态连锁不平衡（linkage d isequilibrium,LD）紧密程度。所有统计检验均为双侧检验，检验水准α=0.05。如果计算结果不符合统计学中的正态分布，通过平方根转换后，进行t检验。 结果： 1、MMPs基因型分布Hardy-Weinberg平衡检验：rs2285053、rs11225395及rs2252073个SNPs位点的基因及基因型频率在两组人群中符合Hardy-Weinberg平衡（P＞0.05）。rs243865位点基因型全部为CC，rs11568818位点基因型全部为AA，有可能rs243865及rs11568818在河南汉族人群中没有多态性，因此不予分析。 2、MMPs基因3个SNPs与CHF之间的相关性：心衰组rs2285053位点的T等位基因频率降低（P=0.043）；心衰组rs11225395位点的T等位基因的频率显著降低（P=0.004），OR=1.966[95%CI（1.236-3.129）]，TT基因型频率与对照组相比也显著降低（P=0.009）；rs225207的G等位基因频率显著增加（P=0.002），OR=0.499[95%CI（0.320-3.779）]，GG基因型频率与对照组相比也显著增加（P=0.007）。 3、MMPs基因启动区3个SNPs单体型分析：CCG单体型的频率在病例组显著高于对照组（P＜0.01），OR=3.436[95%CI（1.888~6.253）]。 结论： 1、与对照组相比，心衰组rs2285053及rs11225395位点的T等位基因频率降低，rs225207位点的G等位基因及单体型CCG的频率升高； 2、rs2285053及rs11225395位点的T等位基因可能会降低个体慢性充血性心力衰竭的患病风险，rs225207位点的G等位基因及单体型CCG可能会增加个体慢性充血性心力衰竭的患病风险。

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