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【6h】

广西肝癌高发区肝癌患者细胞中HBV X基因的整合位点及靶基因分析

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目录

声明

摘要

前言

1 对象与方法

1.1 研究对象

1.2 实验主要仪器及试剂

1.2.1 主要仪器

1.2.2 主要试剂

1.3 实验方法

1.3.1 血清HBVDNA的测定

1.3.2 血清HBeAg检测

1.3.3 血清ALT检测

1.3.4 血清AST检测

1.3.5 组织ILBVDNA的提取

1.3.6 组织Alu-PCR扩增

1.3.7 琼脂糖凝胶电泳

1.3.8 纯化HBV-Alu-PCR产物

1.3.9 测序

1.4 HBVX整合位点及靶基因的确定

1.5 统计学分析

2 结果

2.1 HBV X基因整合片段的扩增

2.2 HBV X基因整合率

2.3 HBV X基因在人类染色体上的整合位点及整合靶基因

2.4 HBV X基因整合与HCC患者临床参数之间的关系

3 讨论

四 研究结论

参考文献

附录

文献综述

致谢

攻读学位期间发表的学术论文

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摘要

目的:探讨乙肝病毒X基因在原发性肝癌细胞染色体的整合规律及其在肝癌发生中的作用。
  方法:应用重复序列-多聚酶链反应(Alu-PCR)的方法扩增30例乙肝病毒相关肝癌组织和配对癌旁组织中整合的HBV X片段,将Alu-PCR纯化后的产物进行测序。测序结果经NCBI BLAST和Map Viewer进行比对,确定HBVX基因整合在人类染色体上的位置和对应的靶基因。
  结果:(1)30例肝癌病例中,17例(56.67%)肝癌组织检测到HBV X基因整合,有2例为正向插入,12例为反向插入,3例同时有正、反向插入宿主基因;26例(86.67%)癌旁组织检测到HBVX基因整合,7例为正向插入,7例为反向插入,12例同时有正、反向插入宿主基因;癌组织和癌旁组织两组间HBV整合率差异有统计学意义(P<0.05)。
  (2)30例肝癌病例中,癌组织定位的11个整合位点对应的基因有8个,分别是P73、TGFRBR2、hTERT、HRAS、HNF1A、P53、TTR、BSG、MLL4;癌旁组织定位的27个整合位点对应的基因有17个,分别是P73、IL10、IRS1、MSH2、hTERT、CDKN1A、KDM4C、IL2RA、HRAS、HNF1A、EDNRB、MAPK3、IL4R、CEPT、TTR、BSG、EP300。
  研究对象的性别、年龄、HBeAg、HBV DNA、ALT、AST与HBV X基因整合无明显的关系。(P>0.05)
  结论:HBV X基因在肝癌细胞染色体上的整合呈不均衡分布,P73、hTERT、HRAS3个基因是广西肝癌高发区常见的整合基因,整合基因与HBV相关性肝癌的发生密切相关。

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