6株猪圆环病毒流行毒株全基因组的序列测序及分析

摘要

Porcine circovirus type2(PCV2)不仅是引起仔猪断奶多系统衰竭征的主要病原体,而且还与其它病症相关.PCV2的危害在于能够使感染猪只的免疫功能受到损害,这种可导致机体免疫抑制的病毒,由于经常以亚临床感染的形式出现,常易被忽视.因此应当进一步加强对PCV2感染的流行病学及分子病学研究.该研究采用PCR诊断技术对所收集的73份疑似PCV2病的病料进行检测,得到18份PCV2阳性病料.采用反向PCR技术对阳性病料中的6株猪圆环病毒Ⅱ型(PCV2)进行全基因的扩增、克隆和测序,得到长度为1768或1767bp的目的基因片段.应用DNAstar序列分析软件对所测定的6株PCV2序列进行同源性分析.结果显示,六株之间的核苷酸同源性为95.5％~100%.应用计算机分析两个主要阅读框ORF1和ORF2并推导其氨基酸序列,分离株ORF1的核苷酸及氨基酸之间的同源性分别为96.9%~100.0%和98.1%~100%,说明ORF1非常保守,这与其编码蛋白的功能有关.分离株ORF2之间的核苷酸及氨基酸同源性分别为92.9%~100%和92.3%~100%,变异相对于ORF1较大,与国外已发表毒株的ORF2比较,发现变异主要发生在三个区域,其中两个与病毒的抗原表位相对应,推测这些变异可能与PCV2抗原性及致病性的改变有关.应用Mega和CLUSTAL分析软件对分离株和国内外已发表的34株PCV2及2株PCV1序列进行比较,并建立了遗传进化树.该进化树主要分为两大群,两个基因型遗传距离上相对较远,分为两群.PCV2各分离株之间存在着某种地理区域上的相关性,分为两大群,以美国和加拿大为代表的一群,以及以法国为代表的一群.该实验分离株皆属第二群,说明广西株与法国株亲缘关系较近.

目录

前言

1病原学

2病毒的分子生物学研究进展

3.圆环病毒在体内的存在及组织嗜向性

4.PCV2对免疫系统的影响

5猪圆环病毒在世界和我国的流行情况及流行原因

6.圆环病毒病发病机理

7.病理变化剖检病变

8.诊断方法

9.与圆环病毒相关的疾病

10.PCV2疫苗及其免疫防制研究进展

11.本研究的目的和意义

材料与方法

1材料

2.方法

实验结果

讨论

结论

参考文献

致谢