声明
摘要
缩写、符号说明
第一章文献综述
1．1 鸡传染性支气管炎病毒病原学的研究概论
1．1．1 鸡传染性支气管炎病毒的分类和形态
1．1．2鸡传染性支气管炎病毒的理化和生物特性
1．2鸡传染性支气管炎发病机理和流行病学
1．2．1 鸡传染性支气管炎的临床症状和病理变化
1．2．2鸡传染性支气管炎的国外流行情况
1．2．3鸡传染性支气管炎的国内流行情况
1．2．4 IBV变异株的研究进展
1．3鸡传染性支气管炎病毒的致病性研究
1．3．1 鸡传染性支气管炎病毒对呼吸器官的致病性
1．3．2鸡传染性支气管炎病毒对生殖器官的致病性
1．3．3 鸡传染性支气管炎病毒对泌尿器官的致病性
1．3．4鸡传染性支气管炎病毒对其他组织器官的致病性
1．4鸡传染性支气管炎病毒基因组
1．4．1 鸡传染性支气管炎病毒基因组结构
1．4．2鸡传染性支气管炎病毒结构蛋白与生物学功能
1．4．3鸡传染性支气管炎病毒非结构蛋白与生物学功能
1．4．4鸡传染性支气管炎病毒非编码区与生物学功能
1．5鸡传染性支气管炎病毒全基因组生物信息学研究现状
1．5．1 鸡传染性支气管炎病毒全基因组测定分析的研究进展
1．5．2生物信息学分析的理论基础
1．5．3糖基化位点与蛋白裂解位点的理论基础
1．5．4基因重组研究与RNA茎环结构研究
1．5．5 蛋白质立体结构研究与分子遗传变异研究
1．6本课题的研究目的和意义
第二章四株广西代表性IBV变异株的全基因组序列测定
2．1 材料
2．1．1 IBV分离株背景
2．1．2主要试剂
2．1．3主要仪器
2．2方法
2．2．1 引物的选择及合成
2．2．2病毒的增殖及纯化
2．2．3 病毒RNA的抽提及cDNA的合成
2．2．4 S1、E、M和N结构基因的克隆及序列测定
2．2．5 高通量测序IBV全基因组序列
2．2．6一代测序与高通量测序的对比分析
2．3 结果
2．3．1 病毒的纯化
2．3．2 IBV S1、E、M和N结构基因序列
2．3．3 IBV全基因组序列
2．3．4一代测序与高通量测序的对比
2．4分析与讨论
2．5 小结
第三章四株广西代表性IBV变异株的生物信息学分析
3．1 材料
3．1．1生物信息学分析数据
3．1．2生物信息学分析软件
3．2 方法
3．2．1 全基因组序列的碱基插入和缺失分析
3．2．2全基因组序列相似性分析
3．2．3 全基因组序列及结构蛋白基因的系统发育分析
3．2．4全基因组序列的重组分析
3．2．5 S1蛋白裂解位点分析
3．2．6糖基化位点分析
3．2．7 RNA茎环结构预测
3．3 结果
3．3．1 全基因组序列的碱基插入和缺失分析结果
3．3．2全基因组序列相似性分析结果
3．3．3全基因组序列及结构蛋白基因的系统发育分析结果
3．2．4全基因组序列的重组分析结果
3．2．5 S1蛋白裂解分析结果
3．2．6糖基化位点分析结果
3．2．7 RNA茎环结构预测结果
3．4分析与讨论
3．5 小结
第四章四株代表性IBV变异株的致病性试验
4．1 材料
4．1．1 试验用SPF鸡胚、SPF鸡及樱桃谷肉鸭
4．1．2主要试剂
4．1．3主要仪器
4．2方法
4．2．1 鸡胚半数感染量(EID50)的测定
4．2．2 SPF鸡及樱桃谷肉鸭分组与攻毒
4．2．3病料的采集与处理
4．2．4试验动物外周血血清抗体水平的检测
4．2．5试验动物组织切片的制作与观察
4．2．6试验动物组织器官病毒载量检测
4．3 结果
4．3．1 鸡胚半数感染量(EID50)的测定结果
4．3．2 临床症状与剖检症状
4．3．3试验动物外周血血清抗体水平检测结果
4．3．4试验动物组织病理变化结果
4．3．5试验动物组织器官病毒载量检测结果
4．4分析与讨论
4．5小结
第五章结论
参考文献
致谢
个人简历
攻读硕士学位期间论文发表情况及参与的科研项目
