利用外显子组测序研究常染色体显性先天性白内障家系的致病基因

摘要

目的：利用外显子组测序技术,定位常染色体显性先天性白内障家系的致病基因。
　　方法：本研究对象为汕头国际眼科中心确诊的一例常染色体显性先天性白内障(ADCC)家系。对家系成员进行全面的临床检查,经知情同意后采集部分家庭成员外周静脉血,提取DNA,选取3个患者的DNA样本,利用IlluminaTrueseq芯片进行外显子捕获,并使用Hi-Seq2000新一代高通量测序仪进行外显子组测序,获得外显子序列信息,对所得外显子组序列进行生物信息学分析,排除非致病性的多态性位点,得到可能与疾病共分离的候选突变。根据外显子组测序分析候选突变的结果,用直接测序技术进行实验验证。
　　结果：该常染色体显性先天性白内障家系为三代遗传的先天性前极性白内障家系,家系成员共13名,其中患者有7名。外显子测序结果提示该家系的患者DNA中骨形态发生蛋白4基因(BMP4)上存在一个突变位点(c.G806A;p.R269Q)与发病相关。通过基因直接测序法验证该基因位点,该突变均出现于采集的患者基因中,而在未患病家属均未被发现,同时200例对照组成员中也未出现此突变,证实其与疾病共分离,表明该基因位点的突变很可能为该家系的致病基因位点。
　　结论：本研究通过外显子组测序定位一例先天性前极性白内障家系的致病基因可能为BMP4基因,经直接测序法验证该基因突变位点与疾病存在共分离。同时表明,外显子组测序在常染色体显性遗传病的研究中可以作为一种快速、经济、有效的方法。

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第一章 前言

1.1 先天性白内障

1.2 先天性白内障的基因学研究背景

1.3 本课题的研究内容

1.4 本课题来源

第二章 研究材料与方法

2.1 研究材料

2.2 研究方法

第三章 结果

3.1 家系的基本特征

3.2 外显子测序结果

3.3 直接测序验证结果

第四章 讨论

第五章 结论

参考文献

附录一

附录二 知情同意书

附录三

致谢

个人简历