中国人群DNA双链断裂修复基因多态性与胶质瘤发病风险的关联性研究

摘要

目的:
　　(1)了解人口学特征、家族史、环境暴露、不良行为习惯等因素对神经胶质瘤发病的影响;
　　(2)了解非同源末端连接修复(NHEJ)途径的几个主要基因位点:LIG4 rs3093737、LIG4rs3093739; XRCC4 rs13161662、XRCC4rs2731858、XRCC4rs7715771;XRCC5 rs828704、 XRCC5rs3770502、 XRCC5rs9288516;XRCC6rs6519265、XRCC6 rs132793;XRCC7 rs10109984的等位基因及基因型在病例组及对照组之间的分布差异;
　　(3)分析调整人口学特征、家族史、环境暴露等因素后，LIG4 rs3093737、LIG4rs3093739;XRCC4 rs13161662、XRCC4rs2731858、XRCC4rs7715771;XRCC5 rs828704、XRCC5rs3770502、XRCC5rs9288516; XRCC6 rs6519265、XRCC6 rs132793;XRCC7 rs10109984对神经胶质瘤易感性的影响;
　　(4)了解同源重组(HR)途径的几个主要基因位点:XRCC3 rs3212092、XRCC3 rs861530、RAD54L rs1048771、NBS1 rs1805794的等位基因及基因型在病例组及对照组之间的分布差异;
　　(5)分析调整人口学特征、家族史、环境暴露等因素后，XRCC3 rs3212092、XRCC3 rs861530、RAD54L rs1048771、NBS1rs1805794对胶质瘤易感性的影响;
　　(6)对今后神经胶质瘤患者筛查与早诊早治提供有价值的参考。
　　方法：
　　收集调查期间经过神经病理学检查确诊的脑胶质瘤患者224例作为病例组研究对象;选择无肿瘤病史、未接受过放化疗、无神经系统疾病史、与对照组无血缘关系的健康体检者作为对照，对照组按照性别、年龄与病例组进行频数匹配，最终共纳入200名调查对象对照组。采用自行设计的调查表收集入组患者的一般人口学特征，包括姓名、性别、年龄、职业、婚姻状况、居住地、经济情况及医疗保障、家族史、吸烟、腌腊制品食用情况、X射线暴露史等信息。采用EDTA-Na2抗凝采血管收集入组调查对象外周静脉血5ml，置于-20℃冰箱中保存待用，按照血液基因组提取试剂盒(DP319)操作步骤进行血液样本基因组的提取。基因多态性的检测采用Taqman探针法进行， SNP位点的选择依据为文献中与肿瘤易感性有关的位点或具有争议的位点。采用25μl的PCR反应体系，在实时荧光定量PCR仪中进行DNA扩增。应用Epidata3.0建立调查数据库，采用SPSS17.0进行统计分析。
　　结果：
　　第一部分:(1)调查对象文化程度主要为小学及以下(96人，占42.86％)，其次为初中（65人，占29.02％）、高中/中专（41人，占18.30％），大学/大专及以上者22人，占9.82％;城区居住者114人，占50.89％，农村居住者110人，占49.11％;婚姻状况为单身者33人，占14.73％，已婚/同居者比例较高，共165人(73.66％)，离婚/丧偶者26人(11.61％);职业以农民为主(92人，占41.07％)，其次为工人（82人，占36.61％），干部21人(9.38％)，其他职业者29人(12.95％)。病例组及对照组各项人口学特征差异均无统计学意义(P＞0.05)。
　　(2)病例组有癌症家族史者占23.66％，对照组为14.00％，两组比例差异具有统计学意义(x2=6.381，P＜0.05)。
　　(3)Hardy-Weinberg平衡吻合度检验结果显示，本次研究NHEJ通路候选基因的SNPs位点各基因型的分布在对照组中均符合Hardy-Weinberg遗传平衡(P值分别为0.633、0.924、0.732、0.057、0.245、0.431、0.095、0.916、0.876、0.993、0.900)，本次研究对象的基因型可以代表本地区中国汉族人群的基因频率分布。
　　(4)LIG4基因的rs3093739、XRCC4基因的rs13161662及rs2731858、XRCC5基因的rs9288516几个位点等位基因频率在两组间分布具有差异(P＜0.05)，LIG4基因、XRCC4基因、XRCC5基因的其余入选位点以及XRCC6、XRCC7入选的全部位点等位基因频率在两组间分布差异无统计学意义(P＞0.05)。
　　(5)LIG4基因的rs3093739、XRCC4基因的rs13161662及rs2731858、XRCC5基因的rs828704、rs9288516几个位点的基因型在两组间分布具有差异(P＜0.05)，LIG4基因、XRCC4基因、XRCC5基因的其余入选位点以及XRCC6、XRCC7入选的全部位点基因型频率在两组间分布差异无统计学意义(P＞0.05)。
　　第二部分:
　　(1)Hardy-Weinberg平衡吻合度检验结果显示，本次研究HR通路候选基因的SNPs位点各基因型的分布在对照组中均符合Hardy-Weinberg遗传平衡（P值分别为0.214、0.268、0.651、0.057），本次研究对象的基因型可以代表本地区中国汉族人群的基因频率分布。
　　(2)将病例组及对照组的等位基因频率进行比较，XRCC3基因的rs3212092、及rs861530、RAD54L基因的rs1048771几个位点的等位基因频率在两组间分布具有差异(P＜0.05)，NBS1基因入选的位点等位基因频率在两组间分布差异无统计学意义(P＞0.05)。
　　(3)将病例组及对照组的基因型频率分布进行比较后发现，XRCC3基因的rs3212092、及rs861530、RAD54L基因的rs1048771几个位点的基因型在两组间分布具有差异(P＜0.05)，NBS1基因入选的位点基因型频率在两组间分布差异无统计学意义(P＞0.05)。
　　(4)应用单因素非条件logistic回归分析对本次HR通路候选基因位点对胶质瘤易感性的影响进行分析，结果显示，XRCC3 rs3212092 CT及TT基因型与CC基因型相比，能够增加1.774倍的患病风险(OR95％C.I.=1.106-2.847)。
　　结论：
　　(1)本次研究候选基因的SNPs位点各基因型的分布在对照组中均符合Hardy-Weinberg遗传平衡，研究对象的基因型可以代表本地区中国汉族人群的基因频率分布。
　　(2)病例组与对照组相关危险因素分析结果中，癌症家族史分布差异具有统计学意义。饮酒、吸烟、喜好食用腌腊制品、从事X射线暴露职业、从事化学品接触职业在两组调查对象中，分布差异均无统计学意义。
　　(3)本次纳入的基因位点中，NHEJ通路的LIG4 rs3093739、XRCC4rs13161662、XRCC4 rs2731858及XRCC5 rs9288516的基因型频率及等位基因频率、XRCC5rs828704的基因型频率在病例组及对照组间分布有差异;HR通路的XRCC3 rs3212092、XRCC3 rs861530、RAD54Lrs1048771的基因型频率及等位基因频率在病例组及对照组间分布有差异。
　　(4)单因素条件Logistic回归分析显示，NHEJ通路的LIG4 rs3093739、XRCC4 rs13161662、XRCC4 rs2731858及XRCC5rs9288516几个位点与胶质瘤的易感性有关;HR通路的XRCC3 rs3212092、XRCC3 rs861530、RAD54Lrs1048771几个位点与神经胶质瘤的易感性有关。
　　(5)多因素条件Logistic回归分析中，调整人口学特征及相关危险因素后，NHEJ通路的LIG4 rs3093739(OR=1.556,OR95％C.I.=1.050-2.305)、XRCC4rs13161662(OR=0.505, OR95％C.I.=0.346-0.736)、XRCC5 rs828704(OR=0.698,OR95％C.I.=0.478-0.920)、XRCC5 rs9288516(OR=1.413, OR95％C.I.=1.071-1.913)与胶质瘤的发生有关;HR通路的XRCC3 rs3212092 CT及TT基因型与CC基因型相比，能够增加1.790倍的患病风险（OR95％C.I.=1.095-2.928）;XRCC3 rs861530 AG及GG基因型与AA基因型相比，患病风险增加(OR=1.401，OR95％C.I.=1.053-1.864)，是影响神经胶质瘤发生的易感基因。

目录

摘要

前言

第一部分 非同源末端连接修复(NHEJ)通路基因多态性与脑胶质瘤遗传易感性的关联

一、对象与方法

二、结果

三、讨论

四、结论

第二部分 同源重组修复(HR)通路基因多态性与脑胶质瘤遗传易感性的关联

一、对象与方法

二、结果

三、讨论

四、结论

参考文献

综述 胶质瘤分子流行病学研究进展

英文缩略词表

致谢

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