基于组iTRAQ技术在类风湿的关节炎患者滑膜组织中差异表达蛋白的初步研究

摘要

目的：本实验应用iTRAQ技术初步分析RA、OA及健康对照组患者滑膜组织中的差异表达蛋白，探讨这些差异表达蛋白及其所参与的代谢通路与RA发病的相关性，为研究RA的形成机理及临床干预提供理论依据。
　　方法：收集兰州大学第二医院2015年3月至2016年7月关节外科RA、OA及健康对照组患者（6例、14例、6例）手术后废弃的滑膜组织作为研究对象。应用iTRAQ技术对蛋白质进行定性、定量分析并对差异表达蛋白进行GO功能分析及KEGG pathway通路注释分析。
　　结果：1.差异表达蛋白定量分析显示：RA组与N组相较，发现395个差异表达蛋白，其中上调蛋白216个，下调蛋白179个；RA组与OA组相比较，存在421个差异表达蛋白，234个上调表达蛋白，187个下调表达蛋白；OA组与N组相比较，共发现326个差异表达蛋白，132个差异表达蛋白表达上调，94个差异表达蛋白下调。
　　2.通过对差异表达蛋白的GO功能注释分析显示，RA组与N组相比较，发现生物学过程的功能分类有24种、分子功能作用有11种、分别位于10种细胞中。RA组与OA组相较存在25种不同的生物学过程、11种分子功能、分别位于10种细胞中。而OA组与N组比较，生物学过程有24种功能分类、分子功能作用有12种、位于11种细胞中。
　　3.通过对差异表达蛋白的KEGG Pathway分析显示，RA组与N组、RA组与OA组、OA组与N组比较，分别存在35条、41条、20条信号通路。
　　结论：1.S100蛋白家族、FIB家族参与了RA的发生、发展，有望成为RA诊断的新的分子标志物。
　　2.MMPs及CRP蛋白水平与RA患者病情活动程度相关。
　　3.PREX1、APO C-I可能参与了RA疾病的发生、发展。
　　4.PI3K-AKT信号通路在RA患者的治疗中具有潜在价值。

目录

声明

缩略词表

第一章 前 言

1.1 研究背景

1.2 iTRAQ技术

第二章 实验仪器及方法

2.1 实验仪器

2.2 实验试剂

2.3相关溶液配制方法

第三章 实验研究方法

3.1 研究对象

3.2 排除标准

3.3 实验方法

3.4实验数据分析

3.5 技术路线图

第四章 实验结果

4.1 BCA法蛋白质浓度测定结果

4.2 SDS-PAGE电泳结果图

4.3 样本标记相关信息

4.4 蛋白质定性结果展示

4.5 蛋白质定量结果统计

4.6差异表达蛋白的GO功能分析

4.7 KEGG Pathway通路注释分析

第五章 讨 论

第六章 结 论

6.1 主要结论

6.2 研究不足及展望

参考文献

在学期间的研究成果

致谢

综述:巨自噬及分子伴侣介导自噬在类风湿关节炎中的相互作用及其联系

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