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胆总管结石患者胆道菌群结构及其与胆总管结石复发的关系研究

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前言

第一章 材料和方法

1.1 研究对象及分组

1.2 样本收集与保存

1.3 实验试剂与仪器

1.3.1 主要实验试剂

1.3.2 主要实验仪器

1.4 DNA提取

1.5 PCR扩增

1.6 文库构建与测序

1.7 生物学信息分析

1.7.1测序数据预处理

1.7.2 OTU聚类分析及物种分类注释

1.8 统计分析

第二章 结果与分析

2.1 研究对象的临床特征

2.2 MiSeq 测序结果

2.3 初发性和复发性胆总管结石患者胆道菌群多样性比较分析

2.3.1 Alpha多样性分析

2.3.2 稀释曲线分析

2.3.3 等级丰度曲线分析

2.3.4 物种累积曲线分析

2.4 初发性和复发性胆总管结石患者胆道菌群分布特征

2.4.1 门水平的比较

2.4.2 纲水平的比较

2.4.3 目水平的比较

2.4.3 科水平的比较

2.4.3 属水平的比较

第三章 讨论

第四章 结论与展望

4.1 结论

4.2 研究的不足与展望

参考文献

综述:胆道微生态与胆总管结石形成关系的研究进展

在学期间的研究成果

致谢

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