声明
第一章 研究背景
1.1 杂交概述
1.2 生殖隔离
1.2.1生殖隔离方式
1.2.2生殖隔离的遗传基础
1.3杂交带
1.3.1杂交带定义
1.3.2杂交带的形成与变化
1.3.3杂交带生殖隔离研究
1.3.4杂交带对基因流的影响
1.4 种间基因流影响群体基因组分化
1.5 杨属简介
1.6 本研究的科学问题
第二章 研究方法
2.1 样品采集与全基因组测序
2.2 全基因组遗传变异分析
2.2.1 测序质量评估及过滤
2.2.2 全基因组序列比对
2.2.3 遗传变异鉴定
2.3 群体基因组学分析
2.3.1 个体亲缘关系鉴定
2.3.2 系统发育分析
2.3.3主成分分析
2.3.4群体结构分析
2.3.5群体遗传多态性计算
2.3.6种间单倍型共享分析（Identical by descent haplotype, IBD）
2.3.7群体重组率计算
2.3.8 连锁不平衡分析及近交分析
2.4群体历史重建
2.5杂种遗传组成及杂交不相容分析
2.6群体分化分析
2.7正选择分析（Positive Selection）
2.8基因流分析
2.8.1 ABBA-BABA分析
2.8.2相对单倍型共享分析 (rIBD)
2.8.3 Gmin分析
2.8.4渐渗基因单倍型Network图构建
第三章 研究结果
3.1 样品采集及测序结果
3.2 群体基因组学研究
3.2.1 系统发育分析
3.2.2 主成分分析
3.2.3 群体结构分析
3.2.4 群体遗传学参数
3.2.5 单倍型共享分析
3.3 群体历史重建
3.4 银灰杨遗传组成及其亲本种杂交不相容分析
3.5群体分化研究
3.6 正选择分析
3.7 基因流分析
3.7.1 ABBA-BABA分析
3.7.2 相对单倍型共享分析（rIBD）
3.7.3 Gmin分析
3.7.4渐渗基因Network图构建
第四章 讨论
4.1 银白杨的近亲繁殖
4.2 杂交带维持及种间杂交不相容
4.3 种间基因流对群体遗传分化的影响
4.4 银白杨与欧洲山杨基因流
4.5 展望
参考文献
附录
在学期间的研究成果
致谢
