红豆草EST-SSR分子标记开发与遗传多样性分析

目录

声明

第一章 前言

第二章 文献综述

2.1 红豆草的研究进展

2.1.1 红豆草的生物学特征研究

2.1.2 红豆草在生产应用价值的研究

2.1.3 红豆草遗传多样性研究

2.1.4 红豆草基因组倍性研究

2.2 分子标记的研究进展

2.2.1 分子标记类型

2.2.2 SSR的优势

2.2.3 EST-SSR分子标记优势

2.3 SSR引物的研究介绍进展

2.3.1 SSR引物类型

2.3.2 SSRs在基因中的分布及其作用

2.4 本研究目的意义和技术路线

2.4.1 本研究目与意义

2.4.2 技术路线

第三章 红豆草转录组测序

3.1 材料与方法

3.1.1 试验材料

3.1.2 RNA提取

3.1.3 cDNA文库建立及测序

3.1.4 序列的组装及注释

3.1.5 EST-SSR分子标记的识别

3.2 结果与分析

3.2.1 转录组测序及从头组装

3.2.2 功能基因注释

3.2.3 红豆草EST-SSR分析

3.3 讨论

第四章 红豆草EST-SSR引物的开发与应用

4.1 材料与方法

4.1.1 试验材料

4.1.2 DNA提取

4.1.3 DNA浓度检测

4.1.4 PCR扩增

4.1.5 凝胶电泳

4.1.6 核酸染料染色及成像

4.2 数据处理

4.2.1 0/1矩阵统计

4.2.2 多态性指标计算

4.3 结果与分析

4.3.1 红豆草遗传多样性分析

4.4 讨论

第五章 用EST-SSR方法印证染色体倍性

5.1 材料与方法

5.1.1 试验材料选择

5.1.2 PCR扩增和凝胶电泳检测

5.1.3 切胶回收

5.1.4 转化大肠杆菌并培养

5.1.5 菌液检验并测序

5.2 结果与分析

5.2.1 EST-SSR与倍性的关系

5.2.2 红豆草单株中测序结果

5.3 讨论

第六章 结论

6.1 结论

6.2 试验创新及展望

参考文献

在学期间的研究成果

附录

致谢