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用生物信息学技术从白色念球菌几丁质合酶基因Cachs 1A,3中筛选排除其可能的RNA干扰调控途径

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附:应用RNA干扰技术从白色念珠菌几丁质合酶基因中筛选治疗白色念珠菌病的可能靶点

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摘要

真菌细胞壁几丁质的合成是一个复杂过程,关键酶是几丁质合酶(CS)。白色念珠菌基因中含4种CS结构基因,其中Cachs1A,3的测序已完成并公布。microRNA(miRNA)是一类调控基因转录后表达的非编码的小分子RNA,它在生物的发育、细胞增殖、凋亡以及胁迫响应等生物过程中发挥着重要的调控作用。目前,分离和鉴定miRNA的方法主要包括实验方法(遗传筛选、直接克隆)和生物信息学方法。miRNA存在表达丰度低,表达组织特异性和受特殊诱导等问题,用传统实验法常难发现和鉴定miRNA。以生物信息学方法预测可能的miRNA,能提高了人们发现或排除可能的miRNA及其靶基因的效率。
  目的:明确白色念珠菌几丁质合酶基因Cachs1A,3无miRNA引发RNA干扰调控途径;
  材料和方法:以Cachs1A.,3基因已知序列分割为源序列,使用miRNA预测软件miR-abela和BayesMiRNAfind分析源序列;
  结果:不能搜索或预测到miRNA,
  讨论:预测证实了Cachs1A.,3基因不存在以同源miRNA发挥RNA干扰,进行翻译前调控的可能途径。

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