福建省HIV-1耐药基因变异现况及MSMHIV-1感染者流行毒株亚型分析研究

摘要

本研究采用基因型耐药性检测的方法，对2008至2010年福建省接受艾滋病抗病毒治疗的患者的CD4+T淋巴细胞计数和病毒载量水平进行监测，评价患者的免疫状态和病毒抑制状况，并对治疗半年以上病毒载量高于1000copies/ml的患者血液样本采用RT-PCR方法扩增pol区蛋白酶和反转录酶基因，扩增阳性片段测序后使用Contig Express软件拼接编辑，序列提交至斯坦福大学HIV耐药数据库获得耐药解释信息。通过对样本的耐药突变位点及频率、耐药种类及程度的分析了解福建省抗病毒治疗人群HIV耐药毒株的发生状况及水平。同时为了解HIV耐药毒株是否发生传播，选择近年研究显示传播性耐药发生的最主要的高危人群——MSM人群为研究对象，参考耐药毒株监测方案，选取2007～2010年福建省艾滋病监测系统发现的尚未开展抗病毒治疗的部分MSM感染者为研究对象，分析原发性耐药基因突变情况。此外，同时研究该人群样本的gag p17-24基因区、env C2-V5或gp41基因区，结合pol基因区序列资料与流行病资料进行研究，阐明HIV-1流行毒株在福建省MSM HIV-1感染人群中的基因亚型分布。
　　 治疗病例的病毒载量检测结果显示，福建省艾滋病病人的总体治疗效果良好，2008年至2010年病毒抑制率分别为88.8％（111/125），84.4％（173/205）和90.3％（270/299）。CD4+T淋巴细胞检测结果显示，治疗病例的免疫状态随着治疗时间延长逐渐恢复，但随后由于耐药出现等原因导致的治疗失败，而出现下降趋势。病毒抑制失败病例的基因耐药检测结果显示25例对非核苷类反转录酶抑制剂（NNRTIs）和核苷类反转录酶抑制剂（NRTIs）出现低度以上程度的耐药。4例对部分蛋白酶抑制剂（PIS）中高度耐药。病毒抑制失败病例的耐药率为69.4％（25/36）。
　　 相对治疗人群的较高的耐药突变发生率，福建省近期感染且尚未开展抗病毒治疗的MSM HIV-1感染者的耐药基因突变率显著较低。50例研究样本中仅5例出现PIS相关位点突变，仅一例数据库解释为对NFV中度耐药，10例样本出现NNRTIs和NRTIS的耐药相关突变，仅1例解释为对NNRTIs的潜在低度耐药。
　　 亚型结果显示，所研究的福建省治疗病人中同时存在B、C两种亚型和CRF01_AE、CRF12_BF2种重组毒株，其中以CRF01_AE亚型为主，占80.6％（29/36）。MSM人群的亚型类别也存在多样化特点，同时存在CRF01_AE、CRF07_BC、CRF08_BC和B亚型，也以CRF01_AE亚型为主，占研究对象的60％（30/50）。三个基因区系统进化树结构相似。基因距离分析显示env区基因变异显著大于gag和pol区，B亚型毒株基因距离最长，提示B亚型毒株在福建MSM人群中流行时间最长。MSM人群的各区基因离散率相对我省其他一般人群较小，说明HIV-1在福建省MSM人群中的流行时间相对较短，需警惕HIV-1在该人群中快速传播的风险。

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文摘

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论文说明：英文缩略词表

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第一部分 福建省HIV-1耐药基因变异现况研究

第二部分 福建省MSM HIV-1感染者流行毒株亚型分析

参考文献

综述 MSM人群中流行的HIV-1毒株

致 谢