IFN-γ基因多态性与福建某地丙型肝炎高流行区HCV感染的相关性研究

摘要

目的：
　　探讨福建某地丙型病毒性肝炎高发流行区汉族人群的干扰素-γ基因多态性与丙型肝炎病毒感染的相关性，为本地区丙型肝炎的防控提供理论依据。
　　方法：
　　以福建某地丙型肝炎高流行区的192例慢性HCV感染者作为病例组，同一地区与之相匹配的186例健康人群作为对照组。采血抽提受试者基因组，应用TaqMan-MGB探针方法对其干扰素-γ基因中包含的+874（rs2430561）、-183（rs2069709）、-764（rs2069707）三个位点进行等位基因检测，计数上述位点等位基因及基因型频率；检验等位基因在对照人群中分布是否符合Hardy-Weinberg遗传平衡定律；采用pearson x2检验对所检出的等位基因及基因型进行关联分析。
　　结果：
　　⑴Hardy-Weinberg平衡检验：对照组中IFN-γ+874位点等位基因的频率分布满足了Hardy-Weinberg遗传平衡检验(χ2=2.0387,P=0.15)，具有群体代表性；
　　⑵IFN-γ基因+874位点等位基因及基因型该位点共检出T、A2个等位基因，TT、AT、AA3个基因型，病例组和对照组等位基因分布分频率分别为 T:85.42％ vs86.83%，A:14.58% vs13.17%。病例组与对照组的等位基因频率分布差异无统计学意义（χ2=0.315,P=0.575）,病例组与对照组基因型分布频率分别为TT：71.35% vs74.19%,AT:28.13% vs25.27%,AA型在两组之间的分布均未超过1%，病例组与对照组基因型分布差异也无统计学意义(χ2=0.394,P=0.821)。
　　⑶IFN-γ基因+874位点基因型与丙型肝炎易感性关系的logistic回归分析+874基因位点基因型与丙型肝炎易感性关系分析尚未发现基因多态性与丙型肝炎的易感性存在明显关联。
　　⑷IFN-γ基因-764、-183位点等位基因和基因型所有样本的IFN-γ基因-764、-183位点检出的等位基因均为G,基因型均为GG型，在病例组与对照组分布无差异。
　　⑸等位基因、基因型与性别及病毒载量的相关性+874位点的优势基因型TT和非优势基因型AT+AA分别与性别、HCV-RNA相关性分析，两组间的性别、HCV-RNA分布差异均无统计学意义（χ2=0.019,P=0.891；χ2=0.424，P=0.515）。+874位点T/A等位基因与性别、HCV-RNA分布差异均无统计学意义（χ2=0.002,P=0.962；χ2=0.239,P=0.625）。
　　结论：
　　⑴中国福建莆田丙型肝炎高流行区人群IFN-γ+874（rs2430561）位点具有多态性，而IFN-γ-183（rs2069709）、-764（rs2069707）位点的基因无多态性；
　　⑵IFN-γ+874（rs2430561）基因多态性与中国福建莆田丙型肝炎高流行区人群慢性HCV感染易感无明显关联。

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前言

材料与方法

1 研究对象

2 主要试剂及仪器

3 实验方法

结果

1.研究对象的基本特征

2 基因组D NA质量检测

3 PCR扩增和SNP分析

4 基因测序法验证

5 Hardy-Weinberg遗传平衡检验

6 IFN-γ+874等位基因及基因型的分布

7 IFN-γ+874基因型与HCV感染风险关系的Logistic回归分析

8 IFN-γ 基因-76 4（rs2069707）位点和-183（rs2069709）位点基因型分析

9 IFN-γ +8 74等位基因、基因型与性别、HCV-R NA载量相关性分析

讨论

结论

参考文献

综述： IFN-γ 基因多态性与丙型肝炎相关性研究进展

致谢