应用SRAP分子标记构建长果种黄麻遗传连锁图谱的研究

摘要

黄麻是天然的纤维作物,在国计民生中具有十分重要的地位。然而其在构建遗传连锁图谱及利用分子标记辅助育种方面,明显滞后于其他主要经济作物。目前,国内尚未有关长果黄麻遗传连锁图谱构建的报道。本研究利用SRAP分子标记构建国内首张长果种黄麻遗传连锁图谱,为长果种黄麻某些重要农艺性状的基因定位、QTL分析及分子标记辅助育种奠定了坚实的理论基础。本研究取得了以下的研究成果:
　　 (1)以甜麻(长果野生种)和宽叶长果(长果栽培种)为亲本,杂交产生F1代,F1自交产生的F2代分离群体(187个单株),作为构图群体。
　　 (2)以甜麻和宽叶长果为模板,从19X27对SRAP上游与下游引物组合中筛选出多态性较好的56对SRAP引物组合。
　　 (3)利用筛选出的56对SRAP引物组合,对F2作图群体进行PCR扩增,共产生155个多态条带,平均每个引物组合产生2.8个多态条带,最多的可以产生6条。
　　 (4)使用Mapmaker/exp3.0,我们构建了包括125个SRAP标记位点的长果种黄麻的遗传连锁图谱,并对长果种黄麻重要质量性状基因进行定位和标记,这些标记被分为10个连锁群(LOD≥3.0),每对标记组合可以产生8～20个大小在100～2000bp清晰可辨的条带,每个连锁群有2～38个标记位点,总长为2231.9cM,两个标记间平均图距为17.86cM。标记问最大间距为36.6cM,最小间距为4.5cM。标记在整个连锁群中分布比较均匀,未出现标记聚集的现象。
　　 (5)质量性状定位:在本图谱中有3个形态标记,分别为托叶色、叶柄色和叶缘色。三者均位于构建的连锁群LG1上,托叶色基因与M18E7及M12E18连锁,遗传距离分别为11.2cM和12cM;叶柄色基因与M17E10及叶缘色基因连锁,遗传距离分别为21.1cM和4.5cM;叶缘色基因还与M12E9-1连锁,遗传距离为20.9cM。
　　 (6)在这155个标记位点当中,有37个(23.9％)偏离3:1的分离比,偏分离比较严重。其中有28个(75.7％)偏向父本(甜麻)带型,其余9个(24.3％)偏向母本(宽叶长果)带型,可能是由配子的选择性引起的。长果种黄麻有7对染色体,而我们构建出10个连锁群,接近染色体数。本研究的平均图距还较大,有待于进一步深化,以期构建出一张标记分布均匀,位点密度较高的长果种黄麻遗传连锁图谱。