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甘蓝型油菜种皮木质素合成相关基因的差异表达分析

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第1章 文献综述

1.1 油菜的概述

1.1.1 油菜的起源与营养价值

1.1.2 油菜饼粕的利用价值

1.2 油菜种皮的结构与成分

1.3.1 木质素概况

1.3.2 木质素的结构

1.3.3 木质素合成途径中关键酶的研究进展

1.3.4 转录因子在木质素合成中的作用

1.3.5 植物激素在木质素合成中的作用

1.3.6 其他影响木质素合成的因素

1.4 转录组测序流程及在植物中的应用

第2章 绪论

2.1 本研究的目的与意义

2.2 研究内容

2.3 技术路线

第3章 材料与方法

3.1.1 田间种植

3.1.2 油菜籽粒品质性状测定

3.1.3 油菜籽粒千粒重测定

3.1.4 油菜籽粒皮壳率测定

3.1.5 试验取材

3.1.6 油菜种皮厚度及染色显微观察

3.2 主要试剂与仪器

3.3 数据分析网站及软件

3.4.1 RNA提取

3.4.2 RNA检测

3.5 转录组测序主要流程方法

3.5.1 测序流程

3.5.2 测序数据分析

3.6 差异表达基因(DEGs)的qRT-PCR验证

3.6.1 qRT-PCR引物设计

3.6.2 RNA反转录

3.6.3 qRT-PCR验证

第4章 结果与分析

4.1 种皮高/低木质素材料的筛选

4.2 高/低木质素材料种子性状分析

4.3 高/低木质素材料种子皮壳率分析

4.4 高/低木质素材料种皮厚度的显微观察

4.5 高/低木质素材料种皮中木质素染色观察

4.6.1 转录组测序概况

4.6.2 差异表达基因的筛选及统计

4.6.3 差异表达基因的功能注释

4.6.4 GO富集分析

4.6.5 TopGO富集分析

4.6.6 COG富集分析

4.6.7 KEGG代谢通路富集分析

4.6.8 编码植物激素合成相关基因表达分析

4.6.9 编码转录因子的差异表达基因分析

4.6.10 BnPAL、BnC4H和Bn4CL表达分析

4.6.11 qRT-PCR验证

第5章 讨论及结论

5.1 讨论

5.1.1 木质素含量与种皮厚度的关系

5.1.2 转录因子对种皮木质素的影响

5.1.3 激素调节对种皮木质素的影响

5.1.4 种皮木质素与类黄酮生物合成过程之间的关系

5.2 结论

5.2.1 高/低木质素极端材料筛选及性状分析

5.2.2 高/低木质素极端材料的RNA-Seq分析

参考文献

附录

致谢

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