声明
第1章 文献综述
1.1.1 根系的形态和基础功能
1.1.2 根系参与植物的胁迫反应
1.1.3 根系对油菜生长和生产的影响
1.1.4 转录因子对根系生长发育的调控作用
1.2.1 GRAS基因家族的定义及分类
1.2.2 GRAS基因家族的生物学功能
1.2.3 GRAS基因家族的起源和进化
1.3.1 ARF基因家族的定义及结构
1.3.2 ARF基因家族的生物学功能及作用机制
1.3.3 ARF基因家族的起源与进化
1.4 本研究目的和意义
第2章 油菜GRAS基因家族的全基因组分析及调控根系发育基因的鉴定
2.1 前言
2.2 材料与方法
2.2.1 甘蓝型油菜基因组中GRAS基因的鉴定
2.2.2 油菜GRAS基因家族的系统发育和GRAS蛋白的理化分析
2.2.3 油菜GRAS基因的结构、染色体定位和共线性分析
2.2.4 油菜GRAS基因的Ka/Ks、miRNA预测和互作蛋白分析
2.2.5 油菜GRAS基因的组织和激素诱导表达模式分析
2.2.6 qRT-PCR法分析油菜GRAS基因胁迫诱导下的表达谱
2.3.1 BnGRASs基因的鉴定和理化性质
2.3.2 BnGRASs基因的系统发育分析
2.3.3 BnGRASs蛋白质的序列特征分析
2.3.4 BnGRASs基因的结构和miRNA靶向预测
2.3.5 BnGRASs基因的染色体定位、共线性和Ka/Ks分析
2.3.6 BnGRASs蛋白的互作网络解析
2.3.7 BnGRASs基因的表达谱分析
2.4 讨论与结论
2.4.1 GRAS基因家族起源、进化和多样化
2.4.2 GRAS基因的功能保守性和多样性
2.4.3miRNA 171在陆地植物中保守地调控GRAS基因的表达
第3章 油菜ARF基因家族的全基因组分析及调控根系发育基因的鉴定
3.1 前言
3.2 材料与方法
3.2.1 油菜ARF基因的鉴定和染色体定位
3.2.2 油菜ARF基因家族的系统发育和共线性分析
3.2.3 油菜ARF蛋白质的序列特征和蛋白互作网络分析
3.2.4 油菜ARF基因的结构、miRNA预测和顺式作用元件分析
3.2.5 油菜ARF基因的组织和激素诱导表达谱分析
3.2.6 qRT-PCR法验证油菜ARF基因的激素诱导表达谱
3.3.1 BnARFs基因的鉴定和染色体位置
3.3.2 BnARFs基因的系统发育分析
3.3.3 BnARFs基因的复制事件分析
3.3.4 BnARFs蛋白的序列特征分析
3.3.5 BnARFs基因的结构和miRNA预测分析
3.3.6 BnARFs基因的顺式作用元件分析
3.3.7 BnARFs蛋白的互作网络分析
3.3.8 BnARFs基因的表达谱分析
3.4 讨论与结论
3.4.1 油菜BnARFs基因的扩增、功能冗余和分化
3.4.2 ARF基因在生长素信号传导途径中的激活和抑制作用
第4章 结 论
4.1 阐明了甘蓝型油菜中GRAS和ARF基因家族的全基因组信息
4.2 筛选了参与根系发育的BnGRASs和BnARFs基因
4.3 探明了GRAS基因家族的分类、起源和进化规律
参考文献
致谢
硕士期间发表论文和参与课题
