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增生性瘢痕和正常皮肤组织成纤维细胞培养上清的蛋白质组成学研究

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论文说明:英文缩写一览表

第一部分 增生性瘢痕组织和正常皮肤组织成纤维细胞培养上清的蛋白质组学研究

前言

材料与方法

结果

讨论

结论

参考文献

第二部分 JurkatT细胞质膜蛋白组学研究初探

前言

材料与方法

结果

讨论

结论

参考文献

全文结论

致谢

文献综述 质膜蛋白质组学

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摘要

增生性瘢痕(hypertrophic scar)是皮肤的纤维增殖紊乱疾病,通常发生于皮肤严重创伤和烧伤后。增生性瘢痕不仅影响患者的外观,而且会严重影响患者的心理健康和功能,使患者的生活质量显著下降,给患者家庭、社会带来了沉重的经济负担。
   增生性瘢痕的主要特点是细胞外基质的过度沉积。由于绝大部分的实验动物比如大鼠、兔子、小鼠和猪不能形成增生性瘢痕,因此增生性瘢痕的研究一直都比较困难。
   以前的研究表明,相比正常皮肤的成纤维细胞,增生性瘢痕组织来源的成纤维细胞分泌更多细胞外基质蛋白(Ⅰ型和Ⅲ胶原等)、蛋白多糖(versican和biglycan等)以及生长因子(TGF-β和胰岛素样生长因子等),但是表达较低的重塑酶,包括胶原酶和其它的基质金属蛋白酶以及小蛋白多糖decorin等。因此成纤维细胞在增生性瘢痕的形成中起着非常关键的作用。
   细胞自身分泌的细胞因子对细胞自身的功能有着重要的作用,影响细胞自身的增值、分化、迁移以及其它的多种功能。因此,在本实验中,我们选择增生性瘢痕组织来源的成纤维细胞和正常皮肤来源的成纤维细胞的培养上清为研究对象,找出两种上清的差异蛋白,以期找到与皮肤瘢痕增生密切相关的蛋白,为探讨瘢痕的形成机制以及治疗和预防瘢痕打下初步的基础。
   方法:
   1.正常皮肤组织和增生性瘢痕组织的成纤维细胞的分离培养:
   正常皮肤组织来源于西南医院泌尿外科包皮组织,增生性瘢痕组织来源于西南医院烧伤研究所烧伤患者。正常成纤维细胞来自本院泌尿外科,增生性瘢痕成纤维细胞来自我所烧伤后一年内患者。分离与培养方法如下:将组织块放入无菌培养皿内,PBS冲洗三遍,无菌剪刀除去表皮部分,剪碎皮下组织;将剪碎后的组织放入25mL锥形培养瓶内,加入0.5%胰酶10mL,室温,轻微振荡2h;加入10mL10%小牛血清DMEM终止消化,将悬液通过无菌滤网过滤后弃去组织碎片;离心,400g/min×10min,弃上清,加入10mL10%小牛血清DMEM洗三遍,再次离心;弃上清后,重悬细胞于10mL10%小牛血清DMEM中,移至75cm2培养瓶中,37℃,5%CO2培养箱内进行培养,24h后更换培养基,同时除去未贴壁细胞。待细胞完全长满后,即可进行传代培养。实验时选用第6代左右的成纤维细胞。
   2.两种细胞培养上清的收集和分离:
   用无血清培养基培养两种细胞六天后,收集培养上清,3000rpm,离心10min,收集上清,然后加入4倍体积-20℃预冷的丙酮,-20℃过夜后,12000rpm,离心30min,弃上清,待丙酮充分挥发后,将蛋白溶于裂解缓冲液,采用Bradford方法进行蛋白定量,然后用10%的SDS-PAGE将上清蛋白分离。
   3.蛋白胶内酶解:
   将含有目的带白的条带切下,胶条片断脱色,冲洗,在二硫苏糖醇还原以及碘乙酰胺烷化后,蛋白在37℃用胰蛋白酶消化过夜。用30%乙腈、0.3%三氟乙酸(TFA)、以及100%乙腈将得到的胰蛋白酶肽从胶条片断中提取出来。
   4.质谱鉴定和分析:
   采用HPLC-CHIP-MS/MS鉴定酶解肽段,质谱仪参数:分离器电压设置在40.0V;Cap Exit为250.2V;Oct1 DC为12.0V;Oct2 DC为4.62 V;Trap Drive为85.0;OctRF为216.3 Vpp;Lens1设置为-5V,Lens2为-60 V。采用Spectrum Mill(RevA.03.02.060;Agilent)搜索引擎软件进行数据分析。根据使用说明书,以胰酶为蛋白酶,在默认的条件下获得原始数据,然后在swiss-prot数据库中搜索针对人的蛋白数据库,允许有两个不完全裂解位点,且包括在搜索中氧化甲硫氨酸和N-末端谷胺酰胺转化成5-氧-2-吡咯烷羧酸的变量修正。如果前向-逆转得分大于2,列1-列2得分大于2,得分阈值大于7.67,得分百分比峰强度大于70%,我们认为肽段是有效的。只有当蛋白具有两个或两个以上的有效肽段、总得分大于25的时候,进行报告。
   5.GO分析:
   通过GO分析,找出上清中的分泌型蛋白以及细胞外基质蛋白,并对这些蛋白进行初步的功能分析。然后查询相关的文献和数据库,找出与增生性瘢痕形成相关的蛋白。
   6.回复性验证:
   通过Western Blotting回复性验证前胶原C内肽酶增强子l在两种上清中的表达情况。通过免疫组化检测其在正常皮肤组织和增生性瘢痕中的表达情况。
   结果:
   1.通过HPI~C-CHIP-MS/MS鉴定,J下常皮肤成纤维细胞培养上清共鉴定出82个蛋白,瘢痕组织来源的鉴定出79个蛋白。经过GO注释,正常皮肤来源的成纤维细胞的上清内有43个蛋白被注释为胞外蛋白,瘢痕来源的有37个。通过比较发现两种细胞共同分泌的蛋白有25个,瘢痕组织成纤维细胞特异性分泌的有12个,正常皮肤的有18个。
   2.通过GO注释,我们对两种细胞分泌蛋白的功能进行了初步分析。从图2可知,两种成纤维细胞分泌蛋白主要具有结合功能,分别为41个和33个蛋白,占各自总分泌蛋白的95.3%和89.2%。正常成纤维细胞分泌蛋白分别有9个(20.9%)具有信号转导和结构分子功能,瘢痕组织的分别为5个(13.5%)和10个(27%).两种细胞分别有8个(18.6%)和9个(24.3%)蛋白具有催化活性。正常皮肽的成纤维细胞分别有1个蛋白具有转运和抗氧化活性,而瘢痕组织的成纤维细胞有6个具有酶调节活性。
   3.通过生物信息学分析和查询相关的数据库以及参考文献,我们认为Vasorin蛋白和前胶原C内肽酶增强子1(Procollagen C-endopeptidase enhancer1)与瘢痕的形成有关。
   4.通过WB,对前胶原C内肽酶增强子1进行了回复性验证,证实了前胶原C内肽酶增强子1瘢痕组织来源的成纤维细胞培养上清中高表达,而在正常皮肤培养上清中不表达。免疫组化结果表明其在正常皮肤组织上皮高表达而在瘢痕组织上皮中低表达。
   结论:
   通过收集培养上清和HPLC-CHIP-MS/MS鉴定,我们建立了瘢痕成纤维细胞和正常皮肤成纤维细胞的分泌蛋白谱,并对其功能进行了初步的分析。通过对比增生性瘢痕组织和正常皮肤组织来源的成纤维细胞的培养上清,我们认为增生性瘢痕组织来源的成纤维细胞表达的Vasorin蛋白、前胶原C内肽酶增强子1与瘢痕组织的形成有密切的关系,为进一步阐明增生性瘢痕组织的发生机制和临床干预打下了初步的基础。

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