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论文说明:英文缩略表
声明
第一章 前言
1.1研究目的和意义
1.2国内外研究现状
1.2.1棉花生殖发育的分子生物学研究
1.2.2肌醇半乳糖苷合酶的研究
1.2.3网格蛋白关联接头蛋白(Clarthrin-associated adaptor protein,AP)复合体的研究
1.2.4 PsbP基因的研究
1.2.5 β呋喃果糖苷酶的研究
1.3本研究的研究内容和策略
第二章 包含arf1和nodulin-like BAC克隆的筛选和全序列测序
2.1材料
2.1.1 BAC文库
2.1.2试剂
2.1.3菌株
2.1.4载体及其特征
2.1.5 PCR扩增引物
2.2方法
2.2.1 PCR池筛法筛选BAC文库的基本原理
2.2.2 LB培养基
2.2.3 BAC文库混合池的构建
2.2.4.质粒DNA的小量提取
2.2.5棉花基因组DNA的提取
2.2.6 PCR反应
2.2.7目的DNA片段的电泳回收
2.2.8连接
2.2.9大肠杆菌感受态细胞的制备
2.2.10质粒DNA转化大肠杆菌
2.2.11 BAC阳性克隆插入片段大小的鉴定
2.2.12 BAC阳性克隆插入片段的全序列测序
2.3结果与分析
2.3.1 BAC文库混合池的构建
2.3.2包含arf1和nodulin-like BAC阳性克隆的筛选
2.3.3 G2-J-15和G128-K-15 BAC阳性克隆插入片段长度的鉴定
2.3.4 G2-J-15 BAC阳性克隆插入片段的全序列测序
2.4小结
第三章 G2-J-15 BAC克隆插入片段的生物信息学分析
3.1方法
3.1.1序列中基因及其结构的预测
3.1.2序列中各基因的ORF BLAST
3.1.3各基因编码的氨基酸序列的分析
3.1.4蛋白质结构及功能预测
3.2结果与分析
3.2.1序列中新基因结构、cDNA及编码蛋白的预测结果
3.2.2各基因编码蛋白的基本性质、序列比对、分析和系统进化树的构建
3.2.3各蛋白序列在TAIR中的BLAST
3.2.4各蛋白序列的疏水结构及信号肽预测分析
3.2.5蛋白质结构及功能预测结果
3.3小结
第四章 各基因的时空表达研究
4.1材料
4.1.1植物材料
4.1.2试剂
4.1.3实时荧光定量PCR(Real-time PCR)扩增引物
4.2方法
4.2.1 RNA提取前仪器及耗材的预处理
4.2.2试剂的准备
4.2.3提取棉花RNA的热硼酸方法(吴巧雯,2007)
4.2.4植物RNAout提取棉花RNA
4.2.5 RNA反转录
4.2.6反转录PCR
4.2.7 Real-time PCR
4.3结果与分析
4.3.1热硼酸法提取棉花RNA
4.3.2反转录PCR及Real-time PCR熔解曲线分析
4.3.3各基因的时空表达模型
4.4小结
第五章 GhGolS和GhAPm的cDNA克隆
5.1材料
5.1.1植物材料
5.1.2试剂
5.1.3菌株
5.1.4载体及其特征
5.1.5相关引物
5.2方法
5.2.1仪器及耗材的预处理(详见4.2.1)
5.2.2试剂的准备(详见4.2.2)
5.2.3提取棉花RNA的热硼酸方法(详见4.2.3)
5.2.4 RNA反转录(详见4.2.5)
5.2.5 PCR
5.2.6目的DNA片段的电泳回收(详见2.2.6)
5.2.7 GATEWAY克隆体系BP重组反应
5.2.8质粒DNA转化大肠杆菌(详见2.2.9)
5.2.9质粒DNA的小量提取(详见2.2.4)
5.3结果与分析
5.3.1 RNA的提取和反转录
5.3.2 PCR
5.3.3 PCR产物同收、BP重组反应、转化、测序和序列拼接
5.4小结
第六章相关基因过表达载体、RNAi载体的构建、转化
6.1材料
6.1.1植物材料
6.1.2试剂
6.1.3菌株
6.1.4载体及其特征
6.1.5 PCR扩增引物
6.2方法
6.2.1 PCR扩增
6.2.2 PCR及酶切产物回收
6.2.3质粒DNA的小最提取(详见2.2.4)
6.2.4 BamH Ⅰ和Sac Ⅰ双酶切反应
6.2.5连接(详见2.2.7)
6.2.6 GATEWAY克隆
6.2.7大肠杆菌感受态细胞的制备(详见2.2.8)
6.2.8根癌农杆菌LBA4404感受态的制备
6.2.9根癌农杆菌LBA4404的转化
6.2.10质粒的大量提取
6.2.11花粉管通道法转化棉花
6.2.12拟南芥的种植
6.2.13根瘤农杆菌LB4404转化拟南芥
6.2.14转基因植株的Kana筛选
6.2.15转基因植株的BASTA筛选
6.2.16 DNA提取(详见2.2.5)
6.3结果与分析
6.3.1 PCR反应
6.3.2相关载体的构建和鉴定
6.3.3拟南芥和棉花的转化
6.4小结
第七章全文结论
7.1阳性BAC克隆的筛选、鉴定、全序列测序和生物信息学分析
7.1.1包含arf1和nodulin-like基因阳性BAC克隆的筛选、鉴定
7.1.2 G2-J-15 BAC克隆全序列测序及生物信息学分析
7.2各基因的时空表达研究
7.3 GhGolS和GhAPm的cDNA克隆
7.4相关基因过表达载体、RNAi载体的构建、转化
7.5创新点
参考文献
致 谢
作者简历