ナノポアDNAシーケンサに向けたEBLによるPtナノポアの作製

摘要

DNAシーケンシングは、PCR法により、対象とする配列を基に、4塩基それぞれの配列特異的停止によって伸長させた、長さの異なるDNA断片を電気泳動し、配列を決定する方法[1]などが行われてきた。近年、新たなDNAシーケンシング方法として、ナノサイズの細孔に単鎖のDNAを通すことで、対象とするDNAの塩基配列を直接かつ連続的に読み取るナノポアDNAシーケンサが、短時間、簡便に解析することができる可能性を秘めているため注目を集めている。ナノポアDNAシーケンサでは、細孔内を塩基が通過する際に細孔を流れるイオン電流を測定することで塩基配列を特定する。したがって、ナノポアDNAシーケンサを実現するにあたっては、DNAの断面積とほぼ等しい孔径3nm以下のナノポアを必要とする。これまでに、特殊な形状のタンパク質により構成されるナノポア DNA シーケンサ[2]が報告されているが、タンパク質素材に起因する耐久性などの課題がある。