Protein contacts; Protein structures; Coarse-grained contact maps; Protein fragments;
机译:点折:由预测骨干结构和联系地图引导的片段无蛋白质结构预测
机译:通过使用预测的联系地图和经常性和残余卷积神经网络的集合来改善蛋白质二级结构,骨干角,溶剂可访问性和接触号的预测
机译:基于对残基接触总特征的预测,分析结构同源蛋白质折叠动力学的差异。
机译:基于片段触点的新蛋白质表示:朝着改善联系地图预测
机译:利用蛋白质三级接触使用序列同源性改善蛋白质结构预测
机译:使用残基间接触和分子间接触图对蛋白质-蛋白质对接模型进行分析和排序
机译:图1:用于:(a)区域的长距离触点的可视化示例,这里增强了来自人胎儿脑细胞的两个10kb分辨率的Hi-C地图。从兴趣点计算联系人高达30个距离距离。顶部到底:jbrowse(Skinner等,2009)截图,具有基因和互动曲线表示(绿色兴趣点,它们的黄色接触预测); HICENTERPLISE交互配置曲线图具有强度(由距离加权)和FDR校正的P值(Q值)的-LOG10,其阈值设置为0.01。 (b)TADS,这里是来自Huvec的第17次染色体的150 KB分辨率Hi-C地图的Hicenterprise可视化。左上三角:原版Hi-C地图接触频率;右下三角形:跨度相互作用的Q值的-log10计算,使用超几何分布计算。