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The pattern of common supersecondary structure (motifs) in protein database

机译:蛋白质数据库中常见的超二级结构(基序)的模式

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摘要

Supersecondary motifs have been analysed in 240 proteins defined at resolutions of 0.25 nm or better. Using five classes of residue conformation (a,b,e,l,t) in the non-regular structure regions, we have identified 50 classes that occur at least five times, and eleven classes that occur more than twenty-five times. The sequence pattern of the eleven most frequently occurring motifs have been characterised. The results should be useful for homology modelling and structure prediction.
机译:已对定义为0.25 nm或更高分辨率的240种蛋白质中的超二级基序进行了分析。使用非规则结构区域中的五类残基构象(a,b,e,l,t),我们确定了至少五次发生的50类残基,以及超过25次的十一类。已经表征了十一个最常见的基序的序列模式。结果对于同源性建模和结构预测应该是有用的。

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