上海及周边地区猪圆环病毒2型基因型分析

摘要

采集上海及周边地区猪内脏样本，进行猪圆环病毒2型（Porcine circovirus type 2,PCV-2）病原学检测，并对阳性样本的ORF2序列进行分析和比对，发现发病猪群PCV-2阳性率为39.06%（25/64），健康猪群阳性率为13.51%（5/37），总的阳性率为29.70%（30/101）。30份阳性样本中PCV-2a亚型为2株，检出率为1.98%（2/101），其余28株均为PCV-2b亚型，检出率为27.72%（28/101）。PCV-2的ORF2序列与已登录的ORF2序列的同源性在90.7%~100%。2株PCV-2a株相互间的同源性为99.6%；28株PCV-2b株的同源性在94.4%~100%，PCV-2b株中只有4株与已登录株DQ141322、AY321984和AY484413株同源性关系最近，处于同一分支中，而另外24株与Q151643中国株同源性关系最近且处于同一分支中。研究结果表明上海及周边地区PCV-2感染比较普遍，发病猪场的感染率远高于健康猪场，且感染率比往年有升高，PCV-2在猪场疫病的爆发和传染中起着重要的协同作用；在PCV-2的感染病例中，PCV-2b亚型为感染的优势毒株；绝大多数PCV-2b ORF2片段的同源性与已登录的一株中国株同源性关系密切，在基因进化树上处于同一分支，但是否可以推断其为PCV-2的另一个亚型有待进一步考证。