猪轮状病毒贵州株VP7基因克隆及序列分析

摘要

猪轮状病毒（Porcine rotavirus，PRV）属呼肠孤病毒科（Reoviridae）轮状病毒属（Rotavirus），VP7是PRV的外衣壳蛋白，也是一种糖基化蛋白，由326个氨基酸组成，因不同毒株而异，分别由7或8、9基因编码，为病毒外膜主要中和抗原，与病毒的毒力及免疫保护性相关。本研究将一株PRV贵州流行株进行了VP7基因的克隆及序列分析，为进一步了解贵州省猪轮状病毒的流行情况、开展轮状病毒疫苗、诊断预防等研究提供参考。猪轮状病毒阳性病料采集自贵州省某发生仔猪腹泻的猪场。参考GenBank发表的猪轮状病毒VP7基因序列设计一对特异性引物，扩增出阳性样本中VP7基因全序列，进行序列测定，并应用DNAStar、MEGA5等生物学软件进行序列比对及分析。研究表明，相同血清型RV间VP7序列高度保守，而不同血清型间则高度变异。本试验根据RCWG（Rotavirus Classification Working group）发布的轮状病毒基因型分类方法将贵州流行株血清型鉴定为G4型。氨基酸序列比较结果显示，贵州流行株与其它血清型毒株氨基酸同源性比较，除个别位点外，绝大部分氨基酸突变都发生在高变区，与GreenK与高秀春等报道一致，而贵州流行株VP7与G4型标准毒株Gottfried氨基酸序列在高变区高度保守。