2006-2011年鲁豫冀地区15株猪繁殖与呼吸综合征病毒GP5蛋白的遗传变异分析

摘要

为研究鲁豫冀地区猪繁殖与呼吸综合征(PRRSV)的遗传变异特征，对2006—2011年分离于山东、河南、河北发病猪场的15株PRRSV分离株，分别采用RT-PCR扩增其GP5基因序列并克隆测序，应用DNAStar等软件分析各分离株GP5序列的遗传变异情况。序列比较结果表明，15株分离株之间的氨基酸同源性为85.6—99.5％，有13株与已知变异株的亲缘关系较近，与JXAl株的氨基酸同源性为95.5—97.5％，2株与经典美洲株VR一2332株亲缘关系相近，氨基酸同源性分别为97.5和98.5％。系统进化树显示，以上1 3株分离株与JXAl株等其他2006年以后分离的变异株处于同一个亚群;鲁豫冀地区的PRRSVGP5蛋白的遗传进化无明显地域分布特征，但与三省区其他PRRSV毒株相比，实验室分离株之间的亲缘关系更为相近;2009年度病毒株在进化树中的分布相对集中。对蛋白氨基酸基序的分析表明，变异株在蛋白跨膜区、中和表位、N糖基化位点、毒力位点等的多个相关位点发生了变异。