鸭坦布苏病毒山东分离株全基因序列分析

摘要

2010年在我国蛋鸭和种鸭养殖场出现一种以产蛋率严重下降的新病。经分离鉴定发现该病病原为坦布苏病毒(Tembusu virus，TMUV)，主要侵害蛋鸭、种鸭的卵巢和输卵管。本研究通过对从山东省产蛋下降鸭群中分离到一株坦布苏病毒，应用RT—PCR及RACE技术对全基因组进行测序，获得了该株坦布苏病毒的全基因组序列。坦布苏病毒是单股正链RNA病毒。RNA全长为10，990 nt，仅含有一个开放阅读框(3419aa)编码11种病毒蛋白。基因组的两端为5’和3’非编码区(NTRs)长度分别为142nt和618 nt。对基因组开放阅读框中的蛋白酶水解位点、潜在糖基化位点、结构蛋白与非结构蛋白与其他黄病毒属病毒的同源性等数据进行分析，结果显示该病毒在遗传相关性上与Bagaza病毒最为相似。比较坦布苏病毒编码区各蛋白与日本脑炎病毒(JEV)，登革热2型病毒(DEN2V)，黄热病毒(YFV)，西尼罗河病毒(wNV)，Bagaza病毒(BAGV)，蜱传脑炎病毒(TBEV)的同源性中发现，坦布苏病毒与Bagaza病毒的同源性最高，与蜱传脑炎病毒的同源性最低，而Bagaza病毒是一种可导致家禽严重发病的病原，坦布苏病毒基因组的特点决定了该病毒对鸭的致病性。