基因测序技术在猪蓝耳病防控中的应用

摘要

2010年对公司历年保存的PRRSV阳性血清和部分问题猪经RT—PCR检出阳性血清，先后送样8次共62个样品，成功测序59个，用DNAStar剪切出完整的ORF5序列，进行基因比对和进化树分析，发现核苷酸置换率为58％，同源性从94．7％～100％不等，整体分化成两大类；PRRSV表现出明显的区域性和时间性，各个商品猪场间的序列均有所差异，不同时间段的样品也有差异。测序结果与目前市面上的疫苗株ch-1a、ch-1R、HuN4-F112、JxA1、IngelvacATP和RespPRRS MLV比对，发现公司商品猪场近4年流行的PRRS毒株与HuN4-F112、JXA1比较接近，表明目前流行的PRRSV以变异株为主。