基于UniGene鉴定山羊microRNA及靶基因

摘要

microRNA(miRNA)是一类长约22nt的非编码小分子RNA，通过与靶基因互补发挥转录后水平的负调控作用。识别和鉴定山羊miRNA及其靶基因，对于揭示miRNA在山羊基因表达调控中的作用至关重要。本文根据miRNA在进化上的保守性，以已知动物的miRNA为搜索序列与山羊的uniGene进行BLAST比对预测得到山羊新的miRNA分子：chi-miR-2284n、chi-miR-421*、chi-miR-421、chi-miR-1839和chi-miR-374b;然后验证这些miRNA分子在皮肤和肌肉中的表达情况并筛选了这些miRNA对应的靶基因。该研究为miRNA及其对应靶基因的筛选提供了标准化流程，可极大方便miRNA-靶基因对的筛选及功能研究。