3个品种猪SLA-DRA基因多态性及其与仔猪腹泻的相关性分析

摘要

为探索猪SLA—DRA基因多态性与仔猪腹泻的相关性，本研究根据猪SLA-DRA基因序列对4个外显子功能区分别设计引物(P 1、P 2、P 3、P 4)，采用PCR-SSCP和克隆测序技术对大白、长白和杜洛克3个引入的商品猪种进行了多态性检测及其与仔猪腹泻的关联分析。结果在引物P 3(外显子3)区未检测到多态性。在引物P 1(外显子1)和引物P 2(外显子2)扩增区分别检测到3个SNPs(AY303990：c．177 A→G、c．178G→A，c.211 T→C)和2个SNPs(AY303990：c.3093 A→C、c．3104 C→T)，均形成了6种基因型(AA、AB、BB、AC，CC，BC)和3个等位基因(A、B、C);在引物 4扩增区检测到6个SNPs(AY303990：c．4081 T→C、c．4167A→G、c.4184 A→G、c．4194 A→G、c.4246 A→G、c.4293G→A)形成了7种基因型(AA、AB、BB、BC、BD、CE、CF)和6种等位基因(A、B、C、D、E、F)。其中突变c．178G→A、c.211 T→C、c.4184 A→G、c．4293 G→A是本研究新发现的。采用最小二乘法拟合线性模型对SLA-DRA多态性与仔猪腹泻评分的关联分析表明，品种和性别在3个引物扩增位点对仔猪腹泻影响均不显著(P>0．05)，P 1引物BC基因型个体的腹泻评分显著高于AA、AB、AC和CC基因型个体(P<0．05)，且AC基因型个体腹泻评分显著高于CC基因型个体(P<0.05);P 2引物AA和BB基因型个体的腹泻评分显著高于AC和CC基因型(P<0.05)，P 4引物AA基因型个体的腹泻评分显著高于AB和BB基因型(P<0.05)。本研究结果显示SLA-DRA基因外显子1、2、4存在多态，其多态性与仔猪腹泻相关，可作为猪抗病育种辅助选择应用中的一个潜在标记位点。